More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0484 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
394 aa  777    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  77.98 
 
 
429 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  70.51 
 
 
446 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  65.53 
 
 
457 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  65.26 
 
 
436 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  63.66 
 
 
436 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  57.94 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  57.41 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  58.2 
 
 
428 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  58.47 
 
 
431 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  46.69 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  42.17 
 
 
430 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  41.88 
 
 
430 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  44 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  40.88 
 
 
429 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  44.86 
 
 
417 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  43.24 
 
 
413 aa  276  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  40.47 
 
 
412 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  42.74 
 
 
413 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  42.74 
 
 
413 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  39.3 
 
 
425 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 
416 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  40.58 
 
 
434 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  40.69 
 
 
444 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  38.01 
 
 
430 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  37.15 
 
 
444 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  38 
 
 
446 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  38.53 
 
 
434 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 
426 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  36.03 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  38.53 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  35.81 
 
 
428 aa  252  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  37.71 
 
 
431 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  39.71 
 
 
434 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  38.76 
 
 
450 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  34.35 
 
 
433 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
449 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
458 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
458 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  38.04 
 
 
453 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  36.13 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  35.53 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  41.38 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  41.86 
 
 
446 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.49 
 
 
452 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  38.81 
 
 
438 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  34.79 
 
 
418 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  41 
 
 
438 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.12 
 
 
443 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  38.57 
 
 
410 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.5 
 
 
443 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  42.3 
 
 
441 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 
444 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  39.43 
 
 
444 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
400 aa  203  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 
444 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 
433 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 
410 aa  200  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.47 
 
 
476 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 
440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.46 
 
 
445 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  38.67 
 
 
439 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.24 
 
 
445 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  37.1 
 
 
426 aa  199  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  41.75 
 
 
437 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  41.75 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  41.75 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  39.07 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.87 
 
 
436 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.33 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.87 
 
 
436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.07 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 
428 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.22 
 
 
429 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 
438 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  39.35 
 
 
424 aa  195  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  38.39 
 
 
442 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 
432 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 
458 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  39.35 
 
 
424 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.2 
 
 
439 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.33 
 
 
428 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38.54 
 
 
482 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38.54 
 
 
482 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 
438 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 
468 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 
438 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  32.23 
 
 
397 aa  192  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  37.89 
 
 
459 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.67 
 
 
437 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  39.8 
 
 
450 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  36.94 
 
 
423 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  37.76 
 
 
445 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
507 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 
422 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>