More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0912 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  100 
 
 
482 aa  981    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 
491 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  31.53 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  31.53 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  33.72 
 
 
478 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  33.88 
 
 
480 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  31.32 
 
 
482 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 
478 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 
478 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  31.42 
 
 
478 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  31.42 
 
 
478 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  31.42 
 
 
478 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  31.42 
 
 
469 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  31.42 
 
 
478 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  31.42 
 
 
469 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  31.42 
 
 
469 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  31.18 
 
 
478 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 
476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  35.24 
 
 
398 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 
428 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  34.63 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  33.5 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  32.56 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
392 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
383 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.63 
 
 
410 aa  170  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  34.05 
 
 
395 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  31.2 
 
 
387 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  30.49 
 
 
472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 
488 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  29.37 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 
444 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  32.31 
 
 
434 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  34.24 
 
 
434 aa  163  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  34.44 
 
 
397 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
471 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  26.8 
 
 
505 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  33.14 
 
 
450 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  34.97 
 
 
439 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  32.81 
 
 
418 aa  159  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  33.61 
 
 
423 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  34.77 
 
 
445 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  32.3 
 
 
438 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  35.22 
 
 
445 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  32.43 
 
 
439 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  31.87 
 
 
418 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  32.63 
 
 
468 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  34.23 
 
 
431 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 
417 aa  156  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  34 
 
 
453 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  30.81 
 
 
377 aa  156  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  33.72 
 
 
524 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  33.72 
 
 
524 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  32.11 
 
 
530 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  32.11 
 
 
524 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  33.43 
 
 
521 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  34.25 
 
 
456 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  33.72 
 
 
524 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  32.11 
 
 
530 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  33.72 
 
 
524 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  32.72 
 
 
530 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  31.99 
 
 
462 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  32.26 
 
 
476 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  32.84 
 
 
482 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  32.84 
 
 
482 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  32.31 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  32.55 
 
 
424 aa  154  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  32.28 
 
 
440 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  33.94 
 
 
437 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  32.55 
 
 
424 aa  154  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  32.88 
 
 
441 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  31.66 
 
 
515 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  32.14 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  30.47 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  31.67 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  33.23 
 
 
444 aa  153  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  33.94 
 
 
458 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  32.78 
 
 
436 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  30.08 
 
 
400 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 
445 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  32.41 
 
 
472 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  31 
 
 
421 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  32.78 
 
 
436 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  31 
 
 
396 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
438 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  29.6 
 
 
445 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
438 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  32.43 
 
 
489 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
452 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  32.55 
 
 
449 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  32.5 
 
 
444 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 
423 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  29.6 
 
 
444 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 
538 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
442 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  32.52 
 
 
470 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  34.9 
 
 
450 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  29.57 
 
 
462 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>