176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2226 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  100 
 
 
455 aa  930    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  40.48 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  40.13 
 
 
447 aa  326  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  21.62 
 
 
400 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  22.25 
 
 
747 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1277  peptidase S41  21.48 
 
 
547 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  26.2 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  23.21 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  22.59 
 
 
691 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  24.73 
 
 
710 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  21.98 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  22.89 
 
 
418 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  21.55 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  22.99 
 
 
692 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2604  hypothetical protein  25.2 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  20.95 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  22.09 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  25.48 
 
 
398 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  22.61 
 
 
484 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  22.82 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  22.25 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  21.85 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  20.58 
 
 
465 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  20.9 
 
 
446 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 
478 aa  57  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  22.33 
 
 
554 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  22.7 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  21.68 
 
 
440 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  21.77 
 
 
479 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  23.16 
 
 
480 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  26.29 
 
 
468 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  20.95 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  28.87 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  22.06 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  20.83 
 
 
447 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  19.46 
 
 
483 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  20.9 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  22.03 
 
 
479 aa  53.9  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  28.51 
 
 
897 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  25.18 
 
 
401 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  23.4 
 
 
423 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  23.16 
 
 
478 aa  53.9  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  21.25 
 
 
431 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  24.54 
 
 
596 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  22.79 
 
 
478 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  23.33 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  23.97 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  23.29 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0730  peptidase S41  21.2 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  21.03 
 
 
443 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  21.51 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  31.76 
 
 
472 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  19.05 
 
 
457 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  23.05 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  20.56 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  22.26 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  21.77 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  22.26 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 
552 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  21.05 
 
 
421 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  20.79 
 
 
482 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  23.29 
 
 
446 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  21.67 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  22.04 
 
 
445 aa  50.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  22.06 
 
 
477 aa  50.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  22.05 
 
 
341 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 
428 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  20.54 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  31.33 
 
 
457 aa  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  22.03 
 
 
449 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 
440 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 
440 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 
440 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  20.41 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  20.34 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  22.18 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  20.74 
 
 
470 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  23.11 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  22.7 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  20.78 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  22.43 
 
 
449 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  20.86 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  22.45 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  24.53 
 
 
550 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  23.62 
 
 
481 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 
431 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  23.05 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  23.98 
 
 
439 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  30.34 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  22.77 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  20.88 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 
538 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  24.49 
 
 
444 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  20.63 
 
 
530 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  32.91 
 
 
440 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  30 
 
 
397 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  21.46 
 
 
435 aa  47.4  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  21.68 
 
 
515 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>