More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2089 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  100 
 
 		 341 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  30.46 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  30.21 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  27.67 
 
 		 449 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  28.61 
 
 		 489 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  25.21 
 
 		 504 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  27.33 
 
 		 484 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4589  peptidase S41  29.02 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  27.93 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  28.75 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  32.16 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  22.89 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  27.2 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  26.58 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  27.68 
 
 		 1090 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  27.75 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  28.72 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  30.37 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  25.71 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  30.23 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  28.19 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  27.78 
 
 		 1193 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  27.39 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  27.63 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  28.99 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  29.59 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  27.35 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  27.31 
 
 		 1067 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  29.08 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  29.1 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  32.53 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  30.92 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  29.29 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  29.53 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  29.41 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 453 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  23.9 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.56 
 
 		 1082 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  28.42 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2822  peptidase S41  27.84 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  27.93 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0702  hypothetical protein  27.78 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  28.79 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  28.79 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  28.28 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  28.79 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0674  C-terminal processing peptidase  28.4 
 
 		 520 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 687 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  30.63 
 
 		 450 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  30.51 
 
 		 472 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  30.91 
 
 		 535 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  28.48 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  26.51 
 
 		 441 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  28.14 
 
 		 426 aa  53.9  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 445 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  31.41 
 
 		 457 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  30.63 
 
 		 436 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 437 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  25.86 
 
 		 534 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  25.29 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  30.08 
 
 		 538 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  29.47 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  30.13 
 
 		 468 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  29.68 
 
 		 477 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  28.57 
 
 		 415 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  28.32 
 
 		 379 aa  52.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  28.79 
 
 		 427 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  25.96 
 
 		 401 aa  52.8  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 437 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.47 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 		 437 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  26.06 
 
 		 398 aa  52.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  28.44 
 
 		 415 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 402 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  30.26 
 
 		 445 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  29.56 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  30.38 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  31.85 
 
 		 451 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  27.05 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>