154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0699 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  100 
 
 		 504 aa  1046    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  23.59 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  25.74 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  25.21 
 
 		 341 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  28.16 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  21.76 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  22.64 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  30.37 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  26.73 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  28.57 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  31.49 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  23.47 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  29.21 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  27.78 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 538 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  24.31 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  26.94 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  27.81 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  28.49 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  26.83 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  23.7 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  24.57 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 440 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 440 aa  53.5  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  24.36 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  23.16 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  26.98 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  26.34 
 
 		 434 aa  52.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  22.29 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 444 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.32 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  26.78 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  21.75 
 
 		 432 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 		 423 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 		 428 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  27.96 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  27.21 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  26.4 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  27.72 
 
 		 452 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 428 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  28.4 
 
 		 335 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  22 
 
 		 427 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 		 462 aa  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  25.64 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  22.11 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 		 710 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  24.62 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  26.02 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  21.67 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  24.16 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  26.11 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  21.43 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  28.49 
 
 		 404 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  25.97 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 440 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  25.17 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  25.96 
 
 		 1016 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 		 547 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  22.64 
 
 		 397 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  27.62 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  36.04 
 
 		 300 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  23.59 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  22.45 
 
 		 569 aa  47  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  27.17 
 
 		 551 aa  47  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  22.58 
 
 		 1090 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  21.61 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  24.86 
 
 		 456 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  24.86 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  26.14 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  25.51 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  27.97 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  31.18 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  22.53 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  25.52 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  22.63 
 
 		 1079 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  23.33 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>