192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3345 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  100 
 
 		 337 aa  697    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  34.82 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  30.65 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  27.74 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  23.36 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  26.65 
 
 		 484 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  27.36 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  31.46 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  26.89 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0745  peptidase S41  26.55 
 
 		 435 aa  69.3  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  22.39 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  25.58 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08930  periplasmic protease  28.3 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135221  normal  0.0516664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  22.22 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0187  peptidase S41  21.31 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  29.87 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  25.95 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 547 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  26.7 
 
 		 679 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  28.83 
 
 		 1193 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  27.84 
 
 		 747 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  28.12 
 
 		 704 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.55 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  28.82 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 		 402 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  28.79 
 
 		 432 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2822  peptidase S41  24.56 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 		 429 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  27.07 
 
 		 678 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  24.54 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 494 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 		 683 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 469 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  31.65 
 
 		 441 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  23.76 
 
 		 672 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  27.22 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  26.23 
 
 		 472 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  22.28 
 
 		 665 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  23.84 
 
 		 480 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  26.16 
 
 		 693 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  24.58 
 
 		 476 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  22.22 
 
 		 668 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 469 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 469 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  23.88 
 
 		 418 aa  49.3  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  24.87 
 
 		 676 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  24.87 
 
 		 692 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 478 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 478 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 478 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 478 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  28.89 
 
 		 681 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  24.87 
 
 		 680 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  24.86 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  27.22 
 
 		 693 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  27.22 
 
 		 704 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 478 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 538 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  24.87 
 
 		 690 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  22.67 
 
 		 478 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  22.65 
 
 		 664 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  24.87 
 
 		 689 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  28.06 
 
 		 705 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 693 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  24.37 
 
 		 535 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 693 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  28.36 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25.68 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  28.36 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  28.36 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  29.85 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  19.86 
 
 		 504 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  28.36 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  28.36 
 
 		 698 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  23.41 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 704 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  25.56 
 
 		 535 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0121  carboxyl-terminal protease  27.52 
 
 		 706 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  22.58 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 704 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  25.13 
 
 		 671 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  25.13 
 
 		 671 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  28.46 
 
 		 690 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.27 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  27.27 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  28.36 
 
 		 673 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  26.72 
 
 		 301 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>