More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2023 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  100 
 
 		 337 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  49.69 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  30 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  29.39 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  28.7 
 
 		 441 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  32.24 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  34.44 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6781  peptidase S41  29.84 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  25.17 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  26.49 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  31.4 
 
 		 698 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  28.3 
 
 		 673 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  31.13 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  26.6 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  31.4 
 
 		 671 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  31.4 
 
 		 671 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  33.6 
 
 		 673 aa  67  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  28.39 
 
 		 680 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  30.41 
 
 		 697 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  27.74 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2885  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 		 698 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000352387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  27.74 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  29.75 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  26.11 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  29.75 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  29.14 
 
 		 687 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  29.05 
 
 		 705 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  29.56 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  37.38 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  30.34 
 
 		 709 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 		 484 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  28.34 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  31.97 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  27.96 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  31.97 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  27.72 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  29.68 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  27.96 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.86 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  25.71 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  29.93 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  27.96 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  28.8 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 		 697 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  27.57 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  29.71 
 
 		 693 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  29.71 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  29.03 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  28.48 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  25.52 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  30.19 
 
 		 719 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  26.49 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  25.79 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  30.15 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  27.12 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0674  C-terminal processing peptidase  31.21 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  29.14 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  32.2 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 693 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  29.28 
 
 		 428 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  26.53 
 
 		 665 aa  59.3  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 704 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  29.31 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 704 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0702  hypothetical protein  30.63 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  30.14 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  26.26 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  28.57 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  27.22 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  27.49 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  29.71 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  24.86 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  29.86 
 
 		 664 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>