More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6781 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6781  peptidase S41  100 
 
 		 347 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  31.63 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  30.17 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  33.16 
 
 		 441 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  28.12 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  26.93 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  29.84 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  31.25 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  29.89 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  32.3 
 
 		 705 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  30.59 
 
 		 553 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  25.48 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  31.72 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  31.72 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  29.35 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  33.9 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  31.47 
 
 		 693 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 721 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  27.98 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  27.98 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1868  periplasmic tail-specific protease  31.88 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435516  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  29.73 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21880  periplasmic tail-specific protease  31.88 
 
 		 698 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0932853  hitchhiker  0.00000629787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  26.02 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  26.02 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  26.02 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  26.02 
 
 		 530 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  27.1 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  26.02 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  26.02 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  26.02 
 
 		 530 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  29.94 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  27.84 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  25.74 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 		 704 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 		 704 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  27.73 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  27.73 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  31.16 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  31.03 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  30.94 
 
 		 705 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  31.16 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  33.11 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  29.86 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  32.88 
 
 		 679 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  28.87 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  28.72 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  28.49 
 
 		 532 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  28.25 
 
 		 707 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  28.17 
 
 		 462 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  31.06 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  26.86 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  31.06 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  32.39 
 
 		 703 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  29.52 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  28.48 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  31.06 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0702  hypothetical protein  31.58 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  24.78 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2885  carboxyl-terminal protease  31.47 
 
 		 698 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000352387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  30.94 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  31.69 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  28.12 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  28.5 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  29.05 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  29.05 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  26.89 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  29.05 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  27.93 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  28 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  28.8 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  29.41 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  29.69 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  29.71 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  29.71 
 
 		 704 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0351  peptidase S41  30.07 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  25.28 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 439 aa  57  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  29.73 
 
 		 709 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  27.91 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 515 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 515 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>