More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0351 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0351  peptidase S41  100 
 
 
336 aa  676    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  63.84 
 
 
367 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  27.55 
 
 
432 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  29.85 
 
 
427 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  28.65 
 
 
482 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  26.33 
 
 
356 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  35.5 
 
 
421 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  28.41 
 
 
483 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  38.22 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.09 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0414  carboxyl-terminal protease  32.1 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  38.46 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  33.74 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  38.69 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  35.47 
 
 
444 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  25.21 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  33.73 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  37.04 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  36.3 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  37.91 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  36.08 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  38.06 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  33.15 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  35.85 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  32.84 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  31.95 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  32.42 
 
 
447 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  32.42 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  33.13 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  33.91 
 
 
710 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  34.39 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  32.34 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  34.39 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  34.57 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  32.02 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  34.81 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  35.77 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  30.36 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  32.07 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  34.22 
 
 
448 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  32.75 
 
 
441 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  34.22 
 
 
448 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.31 
 
 
450 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  31.12 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  27.35 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  27.12 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  32.9 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  30.85 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  32.58 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  32.22 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  31.52 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  27.27 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  34.18 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  33.55 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  32.22 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  31.94 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  32.17 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  28.5 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  34.68 
 
 
428 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  34.91 
 
 
446 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  33.1 
 
 
1024 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  31.87 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  34.46 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  32.48 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  33.88 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  31.87 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 
456 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 
569 aa  65.9  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  38.24 
 
 
444 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  30.54 
 
 
444 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
452 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  34.64 
 
 
475 aa  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>