More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2516 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
1024 aa  2081    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 
1081 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
1072 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3939  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 
1073 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0122378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3853  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 
1073 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  46.93 
 
 
438 aa  297  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  43.2 
 
 
455 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  45.48 
 
 
452 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  42.51 
 
 
444 aa  280  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.82 
 
 
439 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.36 
 
 
444 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  45.13 
 
 
444 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  45.04 
 
 
443 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  45.25 
 
 
455 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  43.85 
 
 
461 aa  271  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  43.24 
 
 
439 aa  270  8.999999999999999e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  45.25 
 
 
424 aa  270  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  45.25 
 
 
424 aa  270  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.52 
 
 
441 aa  270  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.11 
 
 
457 aa  270  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  43.7 
 
 
446 aa  270  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  45.14 
 
 
450 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.61 
 
 
443 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  48 
 
 
440 aa  268  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  46.87 
 
 
458 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  41.71 
 
 
444 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  41.03 
 
 
435 aa  267  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  44.62 
 
 
453 aa  266  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.37 
 
 
482 aa  265  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.37 
 
 
482 aa  265  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  42.62 
 
 
442 aa  265  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  41.98 
 
 
444 aa  264  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  42.39 
 
 
456 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.05 
 
 
419 aa  263  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  41.46 
 
 
440 aa  263  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  46.04 
 
 
426 aa  262  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  41.88 
 
 
441 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  41.73 
 
 
434 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  42.9 
 
 
481 aa  261  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  42.67 
 
 
451 aa  260  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 
468 aa  260  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  42.39 
 
 
451 aa  260  9e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  41.53 
 
 
439 aa  260  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 
476 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 
440 aa  258  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  43.27 
 
 
447 aa  258  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  42.02 
 
 
437 aa  257  8e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  43.67 
 
 
445 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  43.67 
 
 
445 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  45.02 
 
 
445 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 
440 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  45.23 
 
 
440 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  45.86 
 
 
432 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  46.63 
 
 
444 aa  256  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  45.23 
 
 
440 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  45.09 
 
 
446 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 
458 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.3 
 
 
434 aa  255  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  42.36 
 
 
456 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  42.27 
 
 
440 aa  255  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  41.27 
 
 
400 aa  254  8.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  45.35 
 
 
439 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  39.8 
 
 
444 aa  253  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  43.59 
 
 
438 aa  253  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  49 
 
 
440 aa  253  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 
457 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.09 
 
 
423 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  44.31 
 
 
440 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  39.58 
 
 
439 aa  252  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 
438 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 
438 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  46.25 
 
 
438 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  40.27 
 
 
444 aa  250  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  43.98 
 
 
440 aa  250  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
444 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 
437 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.01 
 
 
444 aa  250  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  44.28 
 
 
439 aa  249  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  44.09 
 
 
445 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 
452 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 
410 aa  248  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  43.69 
 
 
428 aa  248  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  45.35 
 
 
436 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  45.35 
 
 
436 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  41.26 
 
 
468 aa  247  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  42.11 
 
 
429 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  41.79 
 
 
462 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  42.53 
 
 
480 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  42.99 
 
 
459 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  39.46 
 
 
444 aa  245  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  43.19 
 
 
483 aa  244  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  39.89 
 
 
438 aa  244  7e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  46.6 
 
 
445 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  39.11 
 
 
463 aa  243  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  44.31 
 
 
433 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  40.88 
 
 
379 aa  240  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 
462 aa  240  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 
423 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  42.98 
 
 
472 aa  238  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  43.32 
 
 
443 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>