More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  100 
 
 
419 aa  850    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05520  C-terminal processing peptidase  50.74 
 
 
424 aa  410  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  50.65 
 
 
404 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 
379 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  34.84 
 
 
409 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  32.52 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  34.16 
 
 
476 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  32.7 
 
 
401 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  29.5 
 
 
401 aa  176  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 
377 aa  176  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  32.92 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  29.92 
 
 
440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  31.1 
 
 
429 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  33.55 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  30.59 
 
 
383 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  29.75 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  33.22 
 
 
402 aa  172  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  32.36 
 
 
440 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  30.3 
 
 
428 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  32.72 
 
 
455 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  31.64 
 
 
458 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  31.64 
 
 
458 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 
440 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  33.44 
 
 
434 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  33.02 
 
 
387 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  34.41 
 
 
442 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  30 
 
 
428 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  34.3 
 
 
412 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  35.35 
 
 
401 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 
446 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  32.05 
 
 
445 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  29.81 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  31.79 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  34.62 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  31.52 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  30.18 
 
 
430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  29.97 
 
 
400 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  35.6 
 
 
389 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  26.89 
 
 
410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  30.57 
 
 
450 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 
377 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  30.36 
 
 
450 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  31.36 
 
 
447 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  32.4 
 
 
463 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  33.12 
 
 
424 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  31.85 
 
 
423 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  29.5 
 
 
427 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  30.86 
 
 
428 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  32.72 
 
 
441 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  34.65 
 
 
440 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  30.25 
 
 
430 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  34.65 
 
 
440 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  27.41 
 
 
429 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  33.12 
 
 
424 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
413 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  33.01 
 
 
434 aa  160  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  33.89 
 
 
440 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  31.76 
 
 
444 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  32.59 
 
 
423 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  27.91 
 
 
389 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  32.11 
 
 
472 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  31.19 
 
 
444 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  34.84 
 
 
440 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 
413 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 
429 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 
413 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  31.83 
 
 
446 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  30.14 
 
 
443 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  29.94 
 
 
430 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  32.83 
 
 
438 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  33.01 
 
 
417 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  32.52 
 
 
437 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  32.7 
 
 
457 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  32.08 
 
 
426 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  32.52 
 
 
439 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 
428 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  31.02 
 
 
442 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 
472 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  32.73 
 
 
438 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  30.51 
 
 
439 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  32.73 
 
 
438 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  32.18 
 
 
445 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
440 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  33.55 
 
 
407 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  33.02 
 
 
446 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  29 
 
 
440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
444 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 
496 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  31.7 
 
 
438 aa  156  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 
496 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  31.46 
 
 
453 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 
505 aa  156  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  29.52 
 
 
431 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  31.79 
 
 
447 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 
398 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  30.21 
 
 
377 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  31.7 
 
 
421 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  29.54 
 
 
452 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  28.19 
 
 
491 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  31.01 
 
 
471 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>