More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3061 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  100 
 
 
356 aa  725    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  34.19 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  35.01 
 
 
430 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  34.73 
 
 
430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  35.75 
 
 
429 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  35.13 
 
 
409 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
413 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  33.99 
 
 
428 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  34.25 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  33.24 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  35.36 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  33.61 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  34.26 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  33.52 
 
 
453 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  34.92 
 
 
444 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  34.17 
 
 
449 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  32.49 
 
 
427 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  32.59 
 
 
447 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  33.06 
 
 
425 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  32.32 
 
 
416 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  33.8 
 
 
412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  31.93 
 
 
446 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  31.27 
 
 
434 aa  179  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  32.42 
 
 
431 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  31.2 
 
 
444 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
458 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
458 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  30 
 
 
440 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  32.4 
 
 
446 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  32.6 
 
 
457 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  31.56 
 
 
444 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  30.73 
 
 
440 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  30.64 
 
 
444 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  30.17 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  32.32 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  29.56 
 
 
427 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  30.68 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  30.11 
 
 
429 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  31.22 
 
 
428 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  31.53 
 
 
436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  33.7 
 
 
476 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  29.56 
 
 
434 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  33.33 
 
 
429 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  29.28 
 
 
434 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  30.19 
 
 
410 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  34.08 
 
 
417 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  31.11 
 
 
450 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  29.65 
 
 
401 aa  156  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  33.66 
 
 
433 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  32.5 
 
 
394 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 
446 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  34.74 
 
 
444 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 
494 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  34.3 
 
 
440 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  33.66 
 
 
397 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  31.91 
 
 
496 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  31.91 
 
 
496 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  31.51 
 
 
389 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  33.12 
 
 
475 aa  150  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
423 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  33.87 
 
 
439 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  34.22 
 
 
440 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  32.57 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  35.81 
 
 
444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  32.89 
 
 
441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 
379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
472 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  33.01 
 
 
450 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  30.66 
 
 
426 aa  146  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  34.62 
 
 
458 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 
445 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  34.32 
 
 
441 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  34.52 
 
 
439 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  35.05 
 
 
444 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  32.31 
 
 
447 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
436 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
438 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  33.22 
 
 
387 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
436 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  32.79 
 
 
443 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  34.19 
 
 
438 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  34.19 
 
 
438 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  33.12 
 
 
429 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  34.19 
 
 
438 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  32.69 
 
 
461 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  33.01 
 
 
452 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 
455 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  35.26 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  35.26 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  33.55 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  33.44 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  33.44 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  33.85 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  32.25 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  29.38 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>