21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00358 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  100 
 
 
348 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  38.68 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  33.9 
 
 
317 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  31.46 
 
 
441 aa  119  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  30.79 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  32.34 
 
 
301 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6781  peptidase S41  27.33 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  28.16 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  26.49 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  31.54 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  31.97 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  28.48 
 
 
341 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  33.55 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  30.87 
 
 
407 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  28 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  31.13 
 
 
443 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  30.1 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1664  peptidase S41  28.57 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.360073  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  22.28 
 
 
379 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  30 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  29.25 
 
 
504 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>