More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1664 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1664  peptidase S41  100 
 
 		 367 aa  723    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.360073  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 		 491 aa  135  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  33.93 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  33.78 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  30.18 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  27.82 
 
 		 446 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  27.79 
 
 		 554 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 427 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  28.3 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  30.34 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  29.9 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  29.55 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  28.97 
 
 		 447 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  28.14 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  29.67 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  30.72 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  30.94 
 
 		 463 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  24.5 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  26.24 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  25.65 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  29.39 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  28.49 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  29.06 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  29.01 
 
 		 557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  28.71 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  31.94 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  30.12 
 
 		 567 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  29.93 
 
 		 453 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  27.95 
 
 		 444 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  29.08 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  28.38 
 
 		 446 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  27.84 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  26.12 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  30.58 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  28.33 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  29.33 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  27.73 
 
 		 1081 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  32.23 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  29.93 
 
 		 440 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  32.67 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  28.9 
 
 		 437 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  29.66 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  28.61 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  28.61 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  27.99 
 
 		 569 aa  106  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 		 1072 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 437 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  31.11 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  30.72 
 
 		 449 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  27.04 
 
 		 538 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  27.41 
 
 		 550 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  28.01 
 
 		 471 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  29.32 
 
 		 566 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  29.58 
 
 		 448 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 		 448 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  27.92 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  33.56 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3853  carboxyl-terminal protease  27.51 
 
 		 1073 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3939  carboxyl-terminal protease  27.51 
 
 		 1073 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0122378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  28.96 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  25.98 
 
 		 435 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  30.43 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  28.69 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  28.61 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  27.3 
 
 		 526 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  31.27 
 
 		 563 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  28.19 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  28.38 
 
 		 530 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 		 522 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  27.12 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  26.23 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  30.9 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  27.78 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  28 
 
 		 526 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  28.43 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>