221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1724 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  100 
 
 		 335 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  42.61 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  36.84 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  36.16 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  32.09 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  30.79 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  30 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  33.96 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  31.67 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6781  peptidase S41  27.45 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  29.06 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  28.51 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  29.83 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  30.57 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  28.09 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  30.05 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  30.57 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  28.85 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  30.05 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  30.37 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 449 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  30.37 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  27.54 
 
 		 1193 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  30.11 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  27.75 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  23.59 
 
 		 897 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  27.55 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  30.68 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  23.21 
 
 		 477 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  29.84 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 440 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  29.84 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  29.1 
 
 		 513 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  29.1 
 
 		 511 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  22.46 
 
 		 477 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  27.36 
 
 		 444 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 481 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 		 530 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  28.42 
 
 		 524 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  28.42 
 
 		 530 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  28.42 
 
 		 524 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  28.42 
 
 		 524 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 		 524 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 		 530 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  28.42 
 
 		 524 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  27.12 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  27.07 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 547 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  26.52 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  26.23 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  28.33 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  30.21 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  26.52 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  26.81 
 
 		 692 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 515 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  30.11 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  28.72 
 
 		 449 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  27.89 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  27.22 
 
 		 427 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  25.97 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  27.89 
 
 		 521 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  27.52 
 
 		 566 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  25.82 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  28.4 
 
 		 504 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 		 440 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  29.23 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  28.04 
 
 		 446 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 453 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 478 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  33.1 
 
 		 504 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.92 
 
 		 447 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  32.07 
 
 		 389 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  28.18 
 
 		 522 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  29.19 
 
 		 526 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08930  periplasmic protease  28 
 
 		 456 aa  49.3  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135221  normal  0.0516664 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0702  hypothetical protein  33.09 
 
 		 434 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  33.06 
 
 		 415 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 550 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  30.43 
 
 		 569 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 538 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  28 
 
 		 445 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  27.37 
 
 		 434 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  23.35 
 
 		 554 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  29.05 
 
 		 402 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  28.02 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  29.79 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  26.74 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>