127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08930  periplasmic protease  100 
 
 
456 aa  908    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135221  normal  0.0516664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  25.94 
 
 
457 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  30.86 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  31.11 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  30.99 
 
 
358 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  26.14 
 
 
450 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  30.17 
 
 
440 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  28.95 
 
 
438 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  29.29 
 
 
433 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  26.33 
 
 
535 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  24.78 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  33.12 
 
 
1484 aa  53.5  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  30.41 
 
 
451 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  27.6 
 
 
389 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  30.88 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  25.97 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  30.95 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  24.28 
 
 
456 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  24.28 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  29.34 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  33.16 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  27.94 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  24.78 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  26.97 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  22.06 
 
 
452 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  26.29 
 
 
447 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  28.09 
 
 
440 aa  50.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  28.14 
 
 
446 aa  50.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3517  peptidase S41  34.48 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0636352  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  29.18 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  28.74 
 
 
439 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  28.35 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  28.74 
 
 
440 aa  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  28 
 
 
335 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.44 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  26.02 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  24.16 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  29.63 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  28.85 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  23.4 
 
 
443 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  24.11 
 
 
428 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  21.97 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  23.05 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  22.9 
 
 
556 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  29.63 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  22.43 
 
 
439 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  25.89 
 
 
463 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  29.33 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 
507 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  26.52 
 
 
680 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  28.27 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  29.17 
 
 
439 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  32.14 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 
710 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  28.96 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  24.16 
 
 
444 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  28.33 
 
 
451 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 
444 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 
498 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 
550 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  23.49 
 
 
649 aa  46.6  0.0009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  23.72 
 
 
468 aa  46.6  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  27.22 
 
 
456 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  24.61 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 
484 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  28.89 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  27.37 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  22.42 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  28.52 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  29.08 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  22.42 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  29.7 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 
538 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  25.15 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  25.56 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  28.49 
 
 
434 aa  45.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  30.28 
 
 
449 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 
555 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>