More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3539 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  100 
 
 		 298 aa  594  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  33.33 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  32.78 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  33.21 
 
 		 335 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  34.43 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  29.89 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  34.02 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  31.34 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  29.31 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  32.18 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  27.98 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  31.94 
 
 		 664 aa  62.4  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2885  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 698 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000352387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  31.91 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  32.77 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  30.43 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  30.69 
 
 		 690 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  36.84 
 
 		 1354 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  31.38 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  30.43 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  28.99 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  30.43 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  30.43 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  32.02 
 
 		 672 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  32.22 
 
 		 683 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000352033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  39.37 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  31.67 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  29.89 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  29.89 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  33.52 
 
 		 665 aa  58.9  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  31.84 
 
 		 681 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  33.16 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  31.41 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  29.73 
 
 		 676 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  29.1 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  34.52 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  30.56 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  30 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2202  carboxy-terminal protease  32.04 
 
 		 681 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.846279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  29.29 
 
 		 427 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  29.35 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  29.35 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  31.28 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3853  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 		 1073 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2440  carboxy-terminal protease  31.49 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  31.91 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  33.15 
 
 		 668 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2601  carboxy-terminal protease  31.11 
 
 		 682 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2447  carboxy-terminal protease  31.49 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1904  carboxy-terminal protease  31.49 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239407  normal  0.209201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2560  carboxy-terminal protease  31.49 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.21905  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  34.01 
 
 		 680 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1585  carboxy-terminal protease  30.73 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00663256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3939  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 		 1073 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0122378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3796  carboxyl-terminal protease  28.43 
 
 		 1072 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  34.71 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  30.72 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  36.43 
 
 		 698 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  24.72 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1673  carboxy-terminal protease  30.94 
 
 		 683 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1748  carboxy-terminal protease  30.94 
 
 		 683 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0158568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1778  carboxy-terminal protease  30.94 
 
 		 683 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  30.92 
 
 		 478 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  35.67 
 
 		 540 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  28.48 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 438 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  33.33 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  31.49 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 		 490 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  33.92 
 
 		 457 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  32.62 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  30.13 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  33.17 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  33.53 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  34.36 
 
 		 483 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 		 440 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  27.78 
 
 		 680 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 		 440 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 426 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2228  carboxy-terminal protease  30.73 
 
 		 683 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3517  peptidase S41  28.66 
 
 		 432 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0636352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  36.72 
 
 		 482 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  28.17 
 
 		 505 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  34.35 
 
 		 569 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  33.09 
 
 		 721 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0351  peptidase S41  33.54 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 		 437 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  32.53 
 
 		 434 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  30.85 
 
 		 479 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.04 
 
 		 434 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  30.07 
 
 		 477 aa  52.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  31.32 
 
 		 428 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  29.33 
 
 		 494 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  32.28 
 
 		 678 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>