99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5799 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  100 
 
 
449 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  33.33 
 
 
484 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  28.78 
 
 
341 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  24.53 
 
 
504 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  24.61 
 
 
489 aa  99.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  27.42 
 
 
337 aa  97.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  32.58 
 
 
298 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2210  peptidase S41  31.82 
 
 
558 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185176  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  23.25 
 
 
1067 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  27.74 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  29.27 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  26.91 
 
 
444 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0745  peptidase S41  19.54 
 
 
435 aa  53.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  28.64 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  29.35 
 
 
444 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.07 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  26.5 
 
 
438 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  30.16 
 
 
482 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  28 
 
 
449 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  30.16 
 
 
482 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  31.2 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  30.21 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  24.11 
 
 
509 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  31.34 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 
418 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 
440 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  27.01 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  26.89 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  29.08 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  29.21 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  27.06 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  28.44 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  34.18 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  27.88 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  27.83 
 
 
458 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  26.91 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3517  peptidase S41  29.41 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0636352  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  26.43 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 
709 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  33.53 
 
 
472 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  27.19 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  29.3 
 
 
438 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 
397 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  26.43 
 
 
445 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1664  peptidase S41  30.46 
 
 
367 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.360073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  28.22 
 
 
439 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  26.77 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 
452 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 
410 aa  46.6  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  22.19 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4589  peptidase S41  22.88 
 
 
309 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  26.92 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  23.55 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  28.36 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  28.64 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  33.33 
 
 
1089 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  27.27 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  27.31 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  28.64 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  24.8 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  26.41 
 
 
1081 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  29.67 
 
 
549 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 
440 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  32.41 
 
 
429 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  27.94 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 
472 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  27.92 
 
 
440 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 
437 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  27.18 
 
 
428 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  27.93 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 
446 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.79 
 
 
1082 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2146  C-terminal processing peptidase-1  26.79 
 
 
712 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 
547 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.88 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  29.38 
 
 
402 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  30 
 
 
465 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  27.86 
 
 
572 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  27.45 
 
 
692 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  22.19 
 
 
457 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  25.62 
 
 
446 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 
401 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  26 
 
 
415 aa  43.1  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.72 
 
 
394 aa  43.1  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>