More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4589 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4589  peptidase S41  100 
 
 		 309 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  29.32 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  34.01 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  28.25 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  27.96 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  31.28 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0351  peptidase S41  25.97 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  34.69 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  30.41 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  30.3 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1664  peptidase S41  33.56 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.360073  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  30.3 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  27.98 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  32.77 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  34.94 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  35.66 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  28.21 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  33.53 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  34.36 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  30.65 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2822  peptidase S41  25 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  36.99 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1111  carboxyl-terminal protease  28.48 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0155619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3517  peptidase S41  31.55 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0636352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09070  C-terminal processing peptidase  31.87 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 		 555 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  41.33 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  31.85 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  34.34 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  30.72 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  32.62 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  31.79 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  31.16 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  29.83 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  31.61 
 
 		 435 aa  57  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  31.53 
 
 		 427 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 423 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  32 
 
 		 439 aa  57  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  35.9 
 
 		 465 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  32.65 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  29.61 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  39.83 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  32 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  32.47 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 472 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  31.05 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  28.99 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  28.48 
 
 		 533 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  27.07 
 
 		 447 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  28.75 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  32 
 
 		 444 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  28.17 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  33.14 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  35.59 
 
 		 560 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  31.69 
 
 		 457 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  31.9 
 
 		 401 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  29.68 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  30.94 
 
 		 428 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  29.68 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  30 
 
 		 439 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  34.12 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  32.07 
 
 		 443 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  28.02 
 
 		 444 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  34.27 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  31.21 
 
 		 394 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 		 457 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  33.57 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  32.64 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  34.27 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  34.27 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  32.3 
 
 		 436 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  30.43 
 
 		 443 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  28.93 
 
 		 664 aa  52.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  32.3 
 
 		 457 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  31.94 
 
 		 446 aa  52.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  28.57 
 
 		 649 aa  52  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  27.06 
 
 		 491 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  30 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 		 444 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  35.46 
 
 		 458 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  32.26 
 
 		 504 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  35.34 
 
 		 582 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  29.73 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  32.93 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 444 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  30.43 
 
 		 470 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 		 725 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  30.59 
 
 		 444 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>