More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1693 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
379 aa  764    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  51.79 
 
 
401 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  39.9 
 
 
426 aa  262  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  37.6 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 
410 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.92 
 
 
452 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  38.07 
 
 
445 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.87 
 
 
456 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.7 
 
 
440 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.9 
 
 
458 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 
457 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 
401 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
440 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  37.82 
 
 
472 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.98 
 
 
451 aa  206  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.96 
 
 
444 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  37.03 
 
 
446 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  38.87 
 
 
447 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 
451 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 
440 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 
440 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 
440 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  36.86 
 
 
482 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 
482 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  39.36 
 
 
448 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  39.36 
 
 
448 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 
476 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.68 
 
 
423 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  35.26 
 
 
401 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 
428 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
441 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  36.03 
 
 
449 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35.83 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  33.75 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  37.91 
 
 
453 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  39 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.83 
 
 
444 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  37.4 
 
 
444 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  36.28 
 
 
401 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.05 
 
 
433 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  38.72 
 
 
453 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 
438 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  35.99 
 
 
401 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 
444 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 
443 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  36.58 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  37.81 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  34.65 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 
463 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  35.08 
 
 
457 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.86 
 
 
450 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  37.8 
 
 
445 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  37.8 
 
 
445 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 
418 aa  196  8.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  34.52 
 
 
400 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
455 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  37.54 
 
 
389 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.98 
 
 
439 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  32.91 
 
 
462 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  35.01 
 
 
409 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  34.69 
 
 
401 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  37.15 
 
 
444 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.31 
 
 
443 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  36.67 
 
 
434 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  34.75 
 
 
439 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  33.58 
 
 
463 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 
429 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  36.99 
 
 
434 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 
468 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  36.32 
 
 
450 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 
455 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  35.13 
 
 
468 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.72 
 
 
443 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 
441 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  32.47 
 
 
434 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  33.61 
 
 
435 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  34.66 
 
 
444 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 
444 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 
379 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 
458 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  32.19 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  36 
 
 
425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  39.7 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  34.09 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.31 
 
 
426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  35.93 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  37.13 
 
 
457 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  32.97 
 
 
407 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  36.03 
 
 
440 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  36.03 
 
 
439 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  36.03 
 
 
440 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  34.09 
 
 
401 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  35.12 
 
 
428 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>