More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1001 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  84.33 
 
 
535 aa  925    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  85.63 
 
 
535 aa  947    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  100 
 
 
533 aa  1097    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1111  carboxyl-terminal protease  93.06 
 
 
533 aa  1027    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0155619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  29.46 
 
 
389 aa  90.9  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  28.36 
 
 
434 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  30.15 
 
 
424 aa  76.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  30.15 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  24.83 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  28.48 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  29.71 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 
472 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  30.68 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  30.04 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  30.04 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  31.17 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  34.15 
 
 
483 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  35.37 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  25.58 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  29.84 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  31.87 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  25 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  27.76 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  28.32 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 
423 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
449 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  27.09 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.42 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  31.66 
 
 
401 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  27.97 
 
 
379 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  27.84 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  29.23 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  27.09 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  28.74 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.86 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  25.88 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  28 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  29.44 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  28.11 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  28.57 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  26.59 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  27 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  26.67 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  29.88 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  28.83 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.3 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  25.14 
 
 
444 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  30.06 
 
 
443 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  29.73 
 
 
463 aa  67  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  32 
 
 
401 aa  67  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 
401 aa  67  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  28.69 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  27.34 
 
 
444 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  33.74 
 
 
449 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  33.13 
 
 
401 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  29.27 
 
 
475 aa  65.9  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 
430 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  26.15 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  26.15 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  29.45 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 
458 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  28.83 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  26.36 
 
 
426 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  22.54 
 
 
554 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 
426 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 
401 aa  65.1  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  30.26 
 
 
423 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  27.88 
 
 
440 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 
457 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.73 
 
 
423 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
476 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 
440 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  29.38 
 
 
407 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 
445 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  25.28 
 
 
444 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 
401 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 
445 aa  64.3  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  26.71 
 
 
397 aa  64.3  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  26.36 
 
 
440 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 
440 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  30.07 
 
 
377 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  30.07 
 
 
377 aa  64.3  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  26.61 
 
 
428 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 
441 aa  63.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  24.11 
 
 
438 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  28.31 
 
 
356 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  27.44 
 
 
471 aa  63.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.06 
 
 
453 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 
418 aa  63.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  26.05 
 
 
440 aa  63.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>