More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1111 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  83.58 
 
 		 535 aa  920    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  93.06 
 
 		 533 aa  1027    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1111  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 533 aa  1099    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0155619  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  86.38 
 
 		 535 aa  949    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  29.84 
 
 		 389 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  26.02 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  27.23 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  29.7 
 
 		 401 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  28.79 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  29.35 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  26.36 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  25.86 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  29.6 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  25.51 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  28.52 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  29.92 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  29.27 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  34.15 
 
 		 483 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.95 
 
 		 423 aa  72  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  33.54 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  28.83 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.42 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  27.84 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  30.25 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  27.42 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  29.87 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  27.61 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  28.44 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  25.79 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  26.2 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  26.63 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  28.92 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  28.92 
 
 		 446 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  26.61 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  28.76 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  28.98 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  30.06 
 
 		 443 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  28.5 
 
 		 458 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  31.68 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  26.37 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  30.07 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  25.88 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  28.72 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  29.51 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  26.46 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  30.54 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  28.48 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  26.23 
 
 		 1024 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  28.98 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  23.75 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05520  C-terminal processing peptidase  32.39 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  27.78 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  31.14 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  26.82 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  26.83 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  31.14 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  31.14 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  27.45 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  23.92 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  30.35 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  22.54 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  30.12 
 
 		 356 aa  67  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  27.21 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 		 491 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  29.76 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  27.73 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  25.63 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  25.31 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  26.4 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>