More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1110 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  90.52 
 
 
535 aa  994    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1111  carboxyl-terminal protease  86.38 
 
 
533 aa  949    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0155619  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  85.63 
 
 
533 aa  947    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
535 aa  1103    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  30.35 
 
 
389 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  28.36 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  29.78 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.75 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  28.02 
 
 
444 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  27.76 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  29.15 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  31.85 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  28.24 
 
 
443 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 
442 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  26.82 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  26.88 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  34.15 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  30.64 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  27.5 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  32.24 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  28.12 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  28.74 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  28.33 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  34.15 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  28.93 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  28.93 
 
 
401 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  28.93 
 
 
401 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05520  C-terminal processing peptidase  29.3 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  28.93 
 
 
401 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 
444 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  32.68 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  29.84 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  26.4 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  32.68 
 
 
377 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  26.4 
 
 
457 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  25.4 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  28.79 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25.68 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  28.99 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  27.31 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  27.98 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  24.74 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  29.63 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  29.27 
 
 
428 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  29.2 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  25.08 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  25.62 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  25.14 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  32.93 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  32.93 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  26.6 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  28.08 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  28.52 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  28.83 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  29.88 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  27.94 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  27.98 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  24.87 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  29.22 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  32.3 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  27.2 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  27.86 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  26.22 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  26.62 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  28.63 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  25.38 
 
 
448 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 
448 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  27.34 
 
 
356 aa  67  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 
423 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  26.97 
 
 
423 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 
430 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  26.54 
 
 
440 aa  67  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  27.93 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  28.57 
 
 
440 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  27.63 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  26.24 
 
 
456 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  27.87 
 
 
434 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>