16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2141 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  100 
 
 		 489 aa  994    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  25.93 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  28.61 
 
 		 341 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  27.89 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  24.5 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  22.41 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  29.56 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  22.39 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  30.09 
 
 		 317 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4589  peptidase S41  28.97 
 
 		 309 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  30.43 
 
 		 465 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  27.08 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  24.87 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  27.91 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  28.87 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.830386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>