22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0259 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0259  peptidase S41  100 
 
 
484 aa  942    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.807068  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  32.81 
 
 
449 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2141  peptidase S41  27.89 
 
 
489 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  27.33 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0699  periplasmic protease-like  28.81 
 
 
504 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113276  hitchhiker  0.00239138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  26.4 
 
 
337 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  31.74 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  26.91 
 
 
451 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  28.76 
 
 
691 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  24.41 
 
 
358 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 
418 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 
550 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  25.27 
 
 
447 aa  47  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  25.76 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.39 
 
 
431 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  30.34 
 
 
482 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  28.77 
 
 
426 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  23.79 
 
 
1090 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  27.72 
 
 
468 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  26.69 
 
 
405 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>