68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3207 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  100 
 
 		 692 aa  1381    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  86.47 
 
 		 691 aa  1157    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2210  peptidase S41  29.01 
 
 		 558 aa  140  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185176  normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3865  peptidase S41  25.39 
 
 		 763 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0264679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  28.68 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  27.42 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.54 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  27.82 
 
 		 483 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  27.11 
 
 		 1193 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.36 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  22.86 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  24.07 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  26.69 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  26.57 
 
 		 427 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  22.99 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.17 
 
 		 432 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  21.77 
 
 		 447 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  22.8 
 
 		 447 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  25.78 
 
 		 446 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.71 
 
 		 1067 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  26.09 
 
 		 434 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  24.13 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.34 
 
 		 410 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1647  peptidase S41  27.03 
 
 		 596 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  25.22 
 
 		 416 aa  52  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  26.81 
 
 		 335 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  29.38 
 
 		 535 aa  51.2  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.91 
 
 		 472 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  25.37 
 
 		 1079 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  24.04 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 402 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  28.74 
 
 		 300 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 417 aa  48.5  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 426 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 402 aa  48.5  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.69 
 
 		 428 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 379 aa  47.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  25.82 
 
 		 444 aa  47.4  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  22.54 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  25.93 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 		 401 aa  47.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.48 
 
 		 1090 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  25.13 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  27.27 
 
 		 534 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1111  carboxyl-terminal protease  24.16 
 
 		 533 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0155619  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 489 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 		 444 aa  45.8  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 415 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 421 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 535 aa  45.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  22.65 
 
 		 463 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  25.55 
 
 		 439 aa  45.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  24.06 
 
 		 681 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  25.06 
 
 		 1094 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  20.78 
 
 		 478 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.79 
 
 		 397 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  25.08 
 
 		 438 aa  45.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  21.57 
 
 		 478 aa  45.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  25.08 
 
 		 533 aa  45.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  23.03 
 
 		 443 aa  44.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  24 
 
 		 434 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.03 
 
 		 1082 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  24.83 
 
 		 1092 aa  44.3  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  23.17 
 
 		 428 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  25.06 
 
 		 1094 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 		 444 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  21.04 
 
 		 428 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>