More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4927 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  100 
 
 		 416 aa  820    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  36.01 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  34.7 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  36.32 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.77 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  24.53 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  23.88 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  27.86 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  23.35 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  25.97 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  26.79 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  26.73 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  32.52 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  26.52 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  26.33 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.28 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  25.35 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  28.22 
 
 		 1067 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  25.17 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  27.07 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  27 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  25.28 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  22.36 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  29.37 
 
 		 1094 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  28.47 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  27.87 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  28.11 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  28.37 
 
 		 1094 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  28.37 
 
 		 1094 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  28.37 
 
 		 1094 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  22.59 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.33 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  27.36 
 
 		 1089 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  23.64 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  27.05 
 
 		 1094 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  25.8 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  22.58 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  25.45 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  27.34 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  24.08 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  27.36 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  27.44 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  22.09 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.26 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  23.15 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  30.83 
 
 		 563 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  28.03 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.56 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  27.55 
 
 		 1093 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  27.55 
 
 		 1093 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  27.76 
 
 		 1092 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  27.66 
 
 		 1094 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  28.22 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  28.22 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  27.56 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  24.82 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  27.04 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  27.55 
 
 		 1093 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  26.88 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  26.07 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  24.2 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  24.21 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  26.83 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  30.38 
 
 		 1181 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  27.87 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  22.6 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  26.98 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  24.09 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>