260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1143 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3411  protease, putative  94.42 
 
 		 1094 aa  2144    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  90.13 
 
 		 1094 aa  2051    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  71.48 
 
 		 1097 aa  1623    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  100 
 
 		 1093 aa  2249    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  99.27 
 
 		 1093 aa  2233    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  71.29 
 
 		 1094 aa  1610    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  71 
 
 		 1092 aa  1626    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  99.09 
 
 		 1093 aa  2233    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  65.32 
 
 		 1084 aa  1481    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  89.76 
 
 		 1094 aa  2039    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  89.95 
 
 		 1094 aa  2045    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  89.85 
 
 		 1094 aa  2043    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  70.47 
 
 		 1104 aa  1607    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  74.13 
 
 		 1094 aa  1689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  89.02 
 
 		 1094 aa  2033    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.89 
 
 		 1167 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  30.23 
 
 		 1089 aa  436  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.38 
 
 		 1117 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  29.16 
 
 		 1104 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1059 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.31 
 
 		 1079 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  29.78 
 
 		 1016 aa  386  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  26.66 
 
 		 1075 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.41 
 
 		 1065 aa  372  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  27.51 
 
 		 1069 aa  337  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  31.83 
 
 		 1181 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  26.71 
 
 		 1147 aa  318  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  30.52 
 
 		 1183 aa  308  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1051 aa  303  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  26.9 
 
 		 1107 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  27.31 
 
 		 1008 aa  298  4e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.63 
 
 		 1067 aa  250  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  36.2 
 
 		 1545 aa  244  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  34.85 
 
 		 1545 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.29 
 
 		 1082 aa  238  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  23.37 
 
 		 1090 aa  233  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  25.32 
 
 		 1125 aa  218  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  30.33 
 
 		 1186 aa  218  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.41 
 
 		 1097 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  22.21 
 
 		 1084 aa  177  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  43.64 
 
 		 1484 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25 
 
 		 1193 aa  154  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.34 
 
 		 1076 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  24.32 
 
 		 1354 aa  127  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.75 
 
 		 425 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.54 
 
 		 483 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.35 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.24 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  23.48 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.22 
 
 		 427 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.74 
 
 		 389 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 		 472 aa  67.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  27.55 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 401 aa  64.3  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  21.77 
 
 		 496 aa  64.3  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  21.77 
 
 		 496 aa  64.3  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  23.71 
 
 		 432 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  24.33 
 
 		 457 aa  62  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  21.35 
 
 		 1071 aa  62  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.6 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.6 
 
 		 402 aa  61.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 397 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  34.25 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 		 484 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  23.15 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.66 
 
 		 1062 aa  59.3  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.46 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  25 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  23.75 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  23.9 
 
 		 377 aa  57.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.19 
 
 		 428 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  23.32 
 
 		 444 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  23.69 
 
 		 431 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  23.3 
 
 		 444 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  32.1 
 
 		 446 aa  56.2  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 444 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  22.02 
 
 		 1138 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.39 
 
 		 428 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  26.6 
 
 		 673 aa  55.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  23.3 
 
 		 478 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 430 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  24.26 
 
 		 446 aa  55.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.12 
 
 		 426 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  22.96 
 
 		 444 aa  55.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 430 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.63 
 
 		 379 aa  55.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  27.93 
 
 		 441 aa  55.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  23.36 
 
 		 480 aa  54.7  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.17 
 
 		 453 aa  54.7  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  24.65 
 
 		 665 aa  54.7  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  23.41 
 
 		 469 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 478 aa  54.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  23.41 
 
 		 469 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  33.77 
 
 		 440 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  23.41 
 
 		 469 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 449 aa  54.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  25.59 
 
 		 682 aa  53.9  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  23.04 
 
 		 434 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  22.96 
 
 		 401 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>