More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5294 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  100 
 
 
1167 aa  2360    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  33.46 
 
 
1075 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  33.12 
 
 
1079 aa  618  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  32.64 
 
 
1104 aa  505  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  32.5 
 
 
1117 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  31.8 
 
 
1059 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  30.56 
 
 
1089 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  29.79 
 
 
1094 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  30.03 
 
 
1093 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  29.85 
 
 
1093 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  29.68 
 
 
1094 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  29.64 
 
 
1094 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  31.64 
 
 
1069 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  29.73 
 
 
1094 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  29.85 
 
 
1093 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  30.64 
 
 
1094 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  30.36 
 
 
1104 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  29.71 
 
 
1094 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  30.24 
 
 
1097 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  28.44 
 
 
1065 aa  438  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  29.69 
 
 
1092 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  29.36 
 
 
1094 aa  433  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  31.39 
 
 
1016 aa  426  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  29.72 
 
 
1084 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  28.3 
 
 
1094 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  29.54 
 
 
1051 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  27.71 
 
 
1186 aa  373  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  29.27 
 
 
1147 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.15 
 
 
1090 aa  365  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  28.36 
 
 
1008 aa  360  7e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.83 
 
 
1082 aa  360  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  29.42 
 
 
1067 aa  348  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  27.41 
 
 
1107 aa  327  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  33.29 
 
 
1183 aa  308  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  34.19 
 
 
1181 aa  306  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  26.25 
 
 
1084 aa  283  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  25.6 
 
 
1354 aa  278  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  24.91 
 
 
1076 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.92 
 
 
1097 aa  271  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  28.85 
 
 
1545 aa  159  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  28.26 
 
 
1545 aa  157  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  28 
 
 
1125 aa  151  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  33.84 
 
 
1484 aa  149  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  28.45 
 
 
1193 aa  149  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  26.62 
 
 
428 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  26.75 
 
 
425 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
969 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.31 
 
 
717 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  27.86 
 
 
427 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.05 
 
 
1005 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  26.65 
 
 
1078 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.81 
 
 
1062 aa  94.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.31 
 
 
1071 aa  91.7  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25 
 
 
1138 aa  89.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.85 
 
 
1066 aa  89.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  21.99 
 
 
1062 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.55 
 
 
429 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  22.5 
 
 
1065 aa  85.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  21.62 
 
 
1062 aa  85.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  21.8 
 
 
1081 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  21.99 
 
 
1062 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.18 
 
 
1067 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  22.02 
 
 
1060 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  22.25 
 
 
1069 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  32.39 
 
 
572 aa  83.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.63 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  22.56 
 
 
1049 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.36 
 
 
1040 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  21.85 
 
 
1062 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.96 
 
 
1042 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  22.31 
 
 
1062 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  29.27 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.05 
 
 
567 aa  78.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  30.27 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.16 
 
 
1042 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  21.85 
 
 
1062 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  27.35 
 
 
1062 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  40.17 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  22.14 
 
 
1062 aa  75.1  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.18 
 
 
407 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.27 
 
 
430 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  24.92 
 
 
432 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23.45 
 
 
1111 aa  73.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  30.82 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.44 
 
 
1059 aa  72.4  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  36.18 
 
 
435 aa  72  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25 
 
 
407 aa  72  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  26.03 
 
 
774 aa  72  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  23.91 
 
 
432 aa  72  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  22.08 
 
 
1084 aa  71.6  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  35.14 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  24.6 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.48 
 
 
1014 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.03 
 
 
660 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.31 
 
 
482 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.44 
 
 
450 aa  71.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  24.37 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  25.98 
 
 
1031 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  35.37 
 
 
461 aa  70.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.73 
 
 
1010 aa  69.7  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>