More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0668 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  42.39 
 
 		 1059 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  33.52 
 
 		 1065 aa  637    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  40.14 
 
 		 1117 aa  687    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  49.57 
 
 		 1147 aa  952    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  42.15 
 
 		 1186 aa  777    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  100 
 
 		 1069 aa  2080    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  52.59 
 
 		 1181 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  39.43 
 
 		 1104 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  56.18 
 
 		 1051 aa  1021    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  49 
 
 		 1107 aa  894    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  40.11 
 
 		 1089 aa  681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  50.7 
 
 		 1183 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  38.1 
 
 		 1016 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  33.14 
 
 		 1008 aa  526  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  30.05 
 
 		 1079 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  31.84 
 
 		 1167 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  28.81 
 
 		 1075 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  29.32 
 
 		 1084 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  27.47 
 
 		 1354 aa  370  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  27.49 
 
 		 1092 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  27.82 
 
 		 1094 aa  350  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  27.79 
 
 		 1093 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  27.48 
 
 		 1093 aa  343  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  27.67 
 
 		 1094 aa  343  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  27.45 
 
 		 1094 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  27.01 
 
 		 1094 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  27.61 
 
 		 1093 aa  341  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  27.11 
 
 		 1094 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  27.45 
 
 		 1104 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  26.55 
 
 		 1094 aa  335  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  26.74 
 
 		 1094 aa  334  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  26.71 
 
 		 1097 aa  334  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  26.32 
 
 		 1094 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  28.41 
 
 		 1067 aa  255  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.52 
 
 		 1097 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  29.04 
 
 		 1193 aa  189  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  28.22 
 
 		 1125 aa  178  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  35.1 
 
 		 1082 aa  177  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  32.72 
 
 		 1090 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.15 
 
 		 1084 aa  168  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  32.22 
 
 		 1545 aa  158  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  31.78 
 
 		 1545 aa  154  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  33.62 
 
 		 1484 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.77 
 
 		 1076 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  25.19 
 
 		 428 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.55 
 
 		 425 aa  91.3  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  24.23 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  27.61 
 
 		 432 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  29.48 
 
 		 1059 aa  70.1  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  26.37 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.98 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  22.33 
 
 		 410 aa  67.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  21.95 
 
 		 401 aa  67.8  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.23 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.56 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  26.18 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 484 aa  63.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 429 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  28.07 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  23.83 
 
 		 434 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  23.49 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  21.88 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.86 
 
 		 482 aa  62  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  24.13 
 
 		 440 aa  62  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  22.32 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  25.44 
 
 		 440 aa  60.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 402 aa  61.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  23.79 
 
 		 423 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  22.74 
 
 		 465 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  24.04 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.35 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  25.52 
 
 		 507 aa  60.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  26.6 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  31.74 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  22.45 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  25 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  31.11 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  34.44 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  26.61 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 		 710 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  26.89 
 
 		 434 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  26.85 
 
 		 440 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 429 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  26.01 
 
 		 446 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  25.3 
 
 		 665 aa  57.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  24.38 
 
 		 445 aa  57.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  22.45 
 
 		 430 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 377 aa  57.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  27.55 
 
 		 440 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 		 452 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  23.39 
 
 		 379 aa  57.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1510 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  28.3 
 
 		 444 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.68 
 
 		 660 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  22.58 
 
 		 683 aa  55.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 377 aa  55.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>