More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0015 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  84.47 
 
 
1067 aa  1906    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  63.32 
 
 
1071 aa  1415    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  77.71 
 
 
1049 aa  1742    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  77.17 
 
 
445 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  80.63 
 
 
598 aa  1038    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  77.48 
 
 
1062 aa  1773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  78.41 
 
 
1062 aa  1787    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  85.18 
 
 
1066 aa  1903    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  52.04 
 
 
1138 aa  1148    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  100 
 
 
1069 aa  2212    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  78.6 
 
 
1062 aa  1797    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  77.81 
 
 
1065 aa  1780    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  77.57 
 
 
1062 aa  1779    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  76.52 
 
 
1062 aa  1761    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  47.9 
 
 
1084 aa  1015    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  46.37 
 
 
1078 aa  997    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  48.42 
 
 
1111 aa  1068    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  48.22 
 
 
1113 aa  1063    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  90.15 
 
 
1081 aa  2033    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  78.22 
 
 
1062 aa  1784    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  77.85 
 
 
1062 aa  1778    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  77.48 
 
 
1062 aa  1773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  79.31 
 
 
1060 aa  1808    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  47.57 
 
 
1062 aa  1065    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28 
 
 
1052 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.89 
 
 
1005 aa  240  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.98 
 
 
1059 aa  226  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.23 
 
 
1042 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  23.96 
 
 
1040 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.24 
 
 
1042 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  23.7 
 
 
1014 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.65 
 
 
1031 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  24.03 
 
 
1010 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26.75 
 
 
1097 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.33 
 
 
1090 aa  102  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  23.35 
 
 
1082 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  23.71 
 
 
1067 aa  98.2  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  24.78 
 
 
496 aa  97.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  26.29 
 
 
420 aa  94.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.69 
 
 
430 aa  94.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.42 
 
 
440 aa  94  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  24.3 
 
 
478 aa  92.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  26.98 
 
 
413 aa  91.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.17 
 
 
672 aa  91.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.27 
 
 
438 aa  91.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.2 
 
 
413 aa  91.7  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  26.98 
 
 
413 aa  91.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  26.24 
 
 
413 aa  91.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  24.55 
 
 
1084 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.37 
 
 
717 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 
443 aa  87.8  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  22.54 
 
 
1075 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.06 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 
969 aa  85.5  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.19 
 
 
680 aa  85.1  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  22.41 
 
 
1167 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.37 
 
 
1125 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.75 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  34.39 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  27.66 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  27.66 
 
 
431 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  23.79 
 
 
702 aa  81.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  27.66 
 
 
431 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  23.38 
 
 
694 aa  80.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  24.04 
 
 
1076 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.63 
 
 
407 aa  80.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  27.66 
 
 
431 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.51 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.48 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  29.33 
 
 
442 aa  79.7  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  24.38 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.23 
 
 
431 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  22.44 
 
 
585 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  27.66 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  23.28 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  27.23 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.38 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  23.34 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.03 
 
 
403 aa  77.4  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  26.83 
 
 
428 aa  77.4  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.7 
 
 
590 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.59 
 
 
483 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.11 
 
 
437 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.5 
 
 
567 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  21.92 
 
 
470 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.42 
 
 
296 aa  77  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  35.53 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  29.95 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.99 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25 
 
 
1193 aa  75.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.18 
 
 
720 aa  75.5  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  22.79 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  24.14 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.99 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  25.48 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.02 
 
 
427 aa  74.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.54 
 
 
444 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.85 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.72 
 
 
436 aa  73.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>