More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0089 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  100 
 
 		 1084 aa  2227    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  35.26 
 
 		 1125 aa  625  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  35.37 
 
 		 1076 aa  622  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  30.04 
 
 		 1067 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.55 
 
 		 1090 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26.55 
 
 		 1097 aa  308  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.36 
 
 		 1082 aa  305  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  26.34 
 
 		 1167 aa  293  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  25.7 
 
 		 1079 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  25.87 
 
 		 1075 aa  277  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  26.03 
 
 		 1193 aa  211  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  22.87 
 
 		 1084 aa  204  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  23.34 
 
 		 1094 aa  199  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  23.3 
 
 		 1104 aa  197  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  22.78 
 
 		 1094 aa  197  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  24.01 
 
 		 1092 aa  196  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  23.53 
 
 		 1089 aa  194  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  23.85 
 
 		 1097 aa  194  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  24.48 
 
 		 1104 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  22.33 
 
 		 1093 aa  191  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  22.24 
 
 		 1093 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  22.24 
 
 		 1093 aa  190  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1059 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  21.61 
 
 		 1094 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  21.92 
 
 		 1094 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  23.15 
 
 		 1069 aa  178  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  21.73 
 
 		 1094 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  21.38 
 
 		 1094 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  21.64 
 
 		 1094 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  22.61 
 
 		 1094 aa  168  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  22.17 
 
 		 1016 aa  137  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  21.95 
 
 		 1008 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1051 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.54 
 
 		 1117 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  27.2 
 
 		 1183 aa  114  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.49 
 
 		 1005 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  29.06 
 
 		 1186 aa  110  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  23.16 
 
 		 1181 aa  109  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  24.57 
 
 		 1065 aa  108  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  26.76 
 
 		 427 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 969 aa  105  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  26.35 
 
 		 425 aa  104  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  23.5 
 
 		 1107 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  23.44 
 
 		 1545 aa  99  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  24.34 
 
 		 1010 aa  98.6  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  23.44 
 
 		 1545 aa  97.8  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.34 
 
 		 1067 aa  95.9  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.66 
 
 		 1071 aa  94.7  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  25.92 
 
 		 428 aa  91.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  25.42 
 
 		 1147 aa  91.3  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.55 
 
 		 1069 aa  89.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.85 
 
 		 1049 aa  89  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.71 
 
 		 1062 aa  89.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.85 
 
 		 1062 aa  89  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  23.11 
 
 		 1062 aa  88.6  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.8 
 
 		 1062 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  23.8 
 
 		 1062 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  24.08 
 
 		 1062 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.46 
 
 		 1060 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.8 
 
 		 1062 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  24.26 
 
 		 1062 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  23.15 
 
 		 1066 aa  84  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.08 
 
 		 660 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  24.21 
 
 		 445 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1042 aa  78.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  23.17 
 
 		 1042 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  22.7 
 
 		 1078 aa  75.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.69 
 
 		 1065 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.17 
 
 		 1059 aa  74.3  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  22.33 
 
 		 1040 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.44 
 
 		 1138 aa  73.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.71 
 
 		 1062 aa  73.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.42 
 
 		 1081 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  27.45 
 
 		 1014 aa  73.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.48 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  25.52 
 
 		 354 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  23.27 
 
 		 1354 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.6 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.39 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.67 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  33.1 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.94 
 
 		 432 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  35 
 
 		 434 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  35 
 
 		 434 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  35 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  34 
 
 		 437 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  39.25 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  28.63 
 
 		 1484 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.97 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  35.78 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  25.54 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  33.33 
 
 		 277 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.11 
 
 		 427 aa  64.3  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  34.31 
 
 		 408 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  25.3 
 
 		 437 aa  64.3  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  34.71 
 
 		 443 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  25.48 
 
 		 421 aa  63.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  26.69 
 
 		 445 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  34.71 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.26 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>