More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2206 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  100 
 
 		 427 aa  856    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  58.54 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  54.74 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  55.86 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  54.2 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  55.64 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  54.81 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  51.48 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  55.11 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  52.22 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  55.64 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  53.48 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  52.52 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  53.94 
 
 		 434 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  53.72 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  52.76 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  53.81 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  54.07 
 
 		 408 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  51.19 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  50.35 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  50.23 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  50.23 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  53.69 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  49.41 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  49.65 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  49.65 
 
 		 431 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  49.18 
 
 		 431 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  49.41 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  47.02 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  49.18 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  48.69 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  51.85 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  50.36 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  49.07 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  49.07 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  49.07 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  48.83 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  48.83 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  48.83 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  48.83 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  48.01 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  46.23 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  44.55 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  43.49 
 
 		 439 aa  358  7e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  43.12 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  45.67 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  43.33 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  41.46 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  42.99 
 
 		 442 aa  343  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  42.56 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  38.26 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  40.57 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  42.17 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  42.49 
 
 		 442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  43.38 
 
 		 474 aa  339  7e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  41.47 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  42.99 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  42.99 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  42.99 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  40.53 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  40.53 
 
 		 440 aa  336  5e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  41.95 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  43.06 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  42.31 
 
 		 442 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  42.01 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  41.69 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  42.31 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  40.42 
 
 		 449 aa  333  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  41.86 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  42.31 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  42.31 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  42.4 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  41.18 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  42.26 
 
 		 414 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  38.08 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  41.67 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  42.08 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  40.77 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  42.14 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  42.32 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  42.08 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  39.24 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  39 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  40.9 
 
 		 442 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  38.06 
 
 		 450 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  40.18 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  43.07 
 
 		 430 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  43.52 
 
 		 430 aa  318  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  38.18 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  42.08 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  41.83 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  42.47 
 
 		 419 aa  316  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  40.19 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  39.49 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  42.22 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  40.15 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  41.36 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  41.36 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  41.36 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>