More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1346 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  100 
 
 		 421 aa  830    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  67.93 
 
 		 426 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  71.96 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  67.78 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  67.54 
 
 		 441 aa  577  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  66.27 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  66.27 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  67.78 
 
 		 440 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  67.82 
 
 		 408 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  64.57 
 
 		 438 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  65.24 
 
 		 421 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  55.47 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  55.58 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  55.64 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  55.31 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  51.31 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  53.79 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  55.8 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  51.07 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  51.07 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  54.36 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  54.76 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  52.58 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  50.48 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  50.24 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  49.76 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  50 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  49.76 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  50 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  48.8 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  50.71 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  50.48 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  49.76 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  49.76 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  49.76 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  50.71 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  48.88 
 
 		 403 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  47.2 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  46.26 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  46.05 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  45.2 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  40.92 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  41.36 
 
 		 442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  43.65 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  40.69 
 
 		 442 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  43.65 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  43.29 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  43.62 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  40.77 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  41 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  40.91 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  41.97 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  40.45 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  40.45 
 
 		 442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  40.45 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  40.45 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  43.97 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  40.23 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  40 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  44.71 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  40 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  40.23 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  40 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  39.86 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  39.86 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  39.95 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  39.81 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  39.77 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  39.53 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  42 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  41.67 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  38.22 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  38.9 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  41.43 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  41.56 
 
 		 414 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  38.89 
 
 		 450 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  39.24 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  40.09 
 
 		 433 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  41.18 
 
 		 419 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  40.91 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  41.16 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  43.11 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  40.66 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  37.06 
 
 		 449 aa  302  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  41.15 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  41.15 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  39.45 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  39.52 
 
 		 442 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  37.39 
 
 		 451 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  40.83 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  40.83 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  40.83 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  41.36 
 
 		 430 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  41.8 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  40.84 
 
 		 431 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  41.67 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>