More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1397 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  84.88 
 
 
430 aa  766    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  84.88 
 
 
430 aa  766    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  84.88 
 
 
431 aa  765    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  84.42 
 
 
431 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  87.67 
 
 
430 aa  788    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  84.65 
 
 
430 aa  765    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  87.67 
 
 
430 aa  787    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  100 
 
 
430 aa  875    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  85.12 
 
 
428 aa  763    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  88.37 
 
 
430 aa  799    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  84.88 
 
 
430 aa  766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  82.79 
 
 
430 aa  751    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  84.88 
 
 
430 aa  766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  84.88 
 
 
430 aa  766    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  84.42 
 
 
431 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  84.42 
 
 
431 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  100 
 
 
430 aa  875    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  84.88 
 
 
430 aa  766    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  100 
 
 
430 aa  875    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  84.42 
 
 
431 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  85.35 
 
 
428 aa  764    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  84.42 
 
 
431 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  56.85 
 
 
434 aa  514  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  52.18 
 
 
450 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  51.36 
 
 
442 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  50.34 
 
 
450 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  51.47 
 
 
442 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  48.89 
 
 
451 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  47.22 
 
 
451 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  47.85 
 
 
441 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  46.56 
 
 
442 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  46.38 
 
 
442 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  45.94 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  45.43 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  47.1 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  46.17 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  45.94 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  46.14 
 
 
440 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  46.4 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  46.24 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  45.48 
 
 
442 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  45.94 
 
 
442 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  46.21 
 
 
442 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  46.21 
 
 
442 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  46.21 
 
 
442 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  47.36 
 
 
441 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  45.94 
 
 
442 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  44.21 
 
 
432 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  43.48 
 
 
435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  40.28 
 
 
432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  43.32 
 
 
432 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  44.21 
 
 
424 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  42.89 
 
 
428 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  45.01 
 
 
433 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  44.14 
 
 
433 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  44.14 
 
 
433 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  46.02 
 
 
423 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  45.78 
 
 
423 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  41.71 
 
 
434 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  44.26 
 
 
423 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  42.79 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  43.58 
 
 
414 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  44.36 
 
 
432 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  44.12 
 
 
432 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  42.4 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  43.73 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  39.62 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  39.62 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  41.88 
 
 
445 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  41.08 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  40.83 
 
 
474 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.05 
 
 
428 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  41.36 
 
 
427 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  40.44 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  40.85 
 
 
419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  40.61 
 
 
419 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  41.04 
 
 
442 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  40.69 
 
 
421 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  39.53 
 
 
425 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  39.62 
 
 
426 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  37.99 
 
 
436 aa  293  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  37.97 
 
 
428 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  41.08 
 
 
429 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  40.1 
 
 
441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  40 
 
 
446 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  38.97 
 
 
438 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  39.95 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  38.17 
 
 
441 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  39.26 
 
 
430 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  39.66 
 
 
425 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  38.88 
 
 
443 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  39.03 
 
 
430 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  40 
 
 
437 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  38.48 
 
 
440 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  38.05 
 
 
421 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  39.12 
 
 
408 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  38.46 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.92 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  38.77 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  39.63 
 
 
431 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>