256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1676 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  56.12 
 
 		 1069 aa  1034    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  44.89 
 
 		 1147 aa  842    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1059 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  37.23 
 
 		 1089 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  44.49 
 
 		 1107 aa  801    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  40.17 
 
 		 1186 aa  723    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 1051 aa  2065    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  37.93 
 
 		 1117 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  36.92 
 
 		 1104 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  48.56 
 
 		 1183 aa  605  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  32.12 
 
 		 1065 aa  599  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  37.46 
 
 		 1016 aa  589  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  48.23 
 
 		 1181 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  33.11 
 
 		 1008 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.82 
 
 		 1167 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  27.84 
 
 		 1079 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.84 
 
 		 1075 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  29.31 
 
 		 1084 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  29.31 
 
 		 1104 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  26.8 
 
 		 1092 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  29.01 
 
 		 1094 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  28.43 
 
 		 1094 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  28.28 
 
 		 1094 aa  327  9e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  28.19 
 
 		 1094 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  27.99 
 
 		 1097 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  28.25 
 
 		 1094 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  28.36 
 
 		 1093 aa  320  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  27.8 
 
 		 1094 aa  318  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  28.18 
 
 		 1093 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  28.33 
 
 		 1093 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  28.36 
 
 		 1094 aa  312  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  26.45 
 
 		 1094 aa  303  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.17 
 
 		 1067 aa  239  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  32.14 
 
 		 1354 aa  239  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.11 
 
 		 1082 aa  229  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.65 
 
 		 1090 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  24.32 
 
 		 1097 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  32.07 
 
 		 1193 aa  158  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  26.92 
 
 		 1545 aa  128  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  27.37 
 
 		 1545 aa  126  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  30.42 
 
 		 1125 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  32.38 
 
 		 1484 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  28.77 
 
 		 1084 aa  109  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.85 
 
 		 1076 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  22.2 
 
 		 428 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  26.62 
 
 		 427 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  22.94 
 
 		 465 aa  77  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  22.49 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  25.91 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  23.98 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.83 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25.43 
 
 		 431 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 446 aa  70.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  24.19 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  24.56 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  26.98 
 
 		 428 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.26 
 
 		 444 aa  67  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.74 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  24.19 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  37.78 
 
 		 449 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.97 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.24 
 
 		 401 aa  63.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  36.46 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 		 377 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 		 428 aa  61.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  23.97 
 
 		 415 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  24.52 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  34.07 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  32.97 
 
 		 442 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  29.95 
 
 		 472 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  36.59 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  23.68 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  21.96 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.86 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  25.61 
 
 		 429 aa  57.4  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  27.19 
 
 		 410 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.16 
 
 		 426 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  25.85 
 
 		 434 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  28.74 
 
 		 509 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 507 aa  57  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  30.45 
 
 		 1059 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  32.2 
 
 		 488 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  26.18 
 
 		 458 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  26.18 
 
 		 458 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  31.13 
 
 		 389 aa  55.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.31 
 
 		 429 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.06 
 
 		 428 aa  54.7  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33 
 
 		 438 aa  54.7  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.57 
 
 		 397 aa  54.3  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  28.4 
 
 		 535 aa  54.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.39 
 
 		 362 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1647  peptidase S41  29.18 
 
 		 596 aa  54.3  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  22.11 
 
 		 427 aa  54.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  29.91 
 
 		 1062 aa  53.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  23.78 
 
 		 429 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  35.63 
 
 		 441 aa  53.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>