298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1339 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  79.8 
 
 		 1097 aa  1845    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  65.3 
 
 		 1084 aa  1482    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  72.97 
 
 		 1094 aa  1682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  74.06 
 
 		 1094 aa  1690    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  73.97 
 
 		 1094 aa  1690    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  74.06 
 
 		 1094 aa  1692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  100 
 
 		 1094 aa  2239    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  72.76 
 
 		 1104 aa  1692    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  74.06 
 
 		 1094 aa  1689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  74.13 
 
 		 1093 aa  1700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  74.04 
 
 		 1093 aa  1700    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  70.62 
 
 		 1094 aa  1608    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  74.41 
 
 		 1094 aa  1704    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  73.95 
 
 		 1093 aa  1700    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  75.05 
 
 		 1092 aa  1730    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  30.45 
 
 		 1167 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  29.15 
 
 		 1079 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  29.4 
 
 		 1089 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  29.3 
 
 		 1104 aa  403  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.35 
 
 		 1117 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1059 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.23 
 
 		 1075 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  28.64 
 
 		 1016 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.84 
 
 		 1065 aa  360  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  27.76 
 
 		 1069 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  27.66 
 
 		 1147 aa  330  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1051 aa  315  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  26.87 
 
 		 1107 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  28.34 
 
 		 1008 aa  295  3e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  30.18 
 
 		 1181 aa  287  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  29.39 
 
 		 1183 aa  280  9e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  25.46 
 
 		 1186 aa  262  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.59 
 
 		 1067 aa  252  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  34.45 
 
 		 1545 aa  247  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  34.23 
 
 		 1545 aa  245  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.04 
 
 		 1082 aa  241  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24 
 
 		 1090 aa  239  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.88 
 
 		 1097 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.05 
 
 		 1125 aa  204  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.79 
 
 		 1076 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  40.42 
 
 		 1484 aa  163  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  22.5 
 
 		 1084 aa  160  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  24.82 
 
 		 1193 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  24.03 
 
 		 1354 aa  128  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.88 
 
 		 425 aa  88.6  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.18 
 
 		 482 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.07 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  23.48 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  25.81 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.75 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.53 
 
 		 465 aa  77.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  25.75 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.75 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  23.68 
 
 		 1138 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  24.51 
 
 		 429 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  23.69 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.24 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  24.13 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  24.38 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.5 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  29.48 
 
 		 416 aa  63.9  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.13 
 
 		 457 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  24.06 
 
 		 434 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  21.12 
 
 		 1071 aa  62  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  24.75 
 
 		 472 aa  62  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 428 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  27.15 
 
 		 446 aa  61.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  20.84 
 
 		 1069 aa  61.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  20.46 
 
 		 1059 aa  60.1  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 		 427 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 		 429 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  22.41 
 
 		 447 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  22.18 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  22.18 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  23.63 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  31.97 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  24.93 
 
 		 440 aa  57.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  22.96 
 
 		 401 aa  57.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 377 aa  57  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  24.77 
 
 		 480 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  21.22 
 
 		 1081 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  26 
 
 		 428 aa  57  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  25.88 
 
 		 389 aa  57.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  22.67 
 
 		 444 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  25.83 
 
 		 423 aa  55.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.43 
 
 		 667 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  25.75 
 
 		 428 aa  55.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  22.71 
 
 		 412 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 436 aa  56.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  26.5 
 
 		 415 aa  55.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.6 
 
 		 484 aa  55.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  25.56 
 
 		 444 aa  55.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 		 379 aa  55.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.49 
 
 		 1028 aa  55.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  25.97 
 
 		 444 aa  55.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 401 aa  55.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  23.64 
 
 		 476 aa  55.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>