More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0703 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  100 
 
 
437 aa  874    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  71.6 
 
 
434 aa  597  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  71.6 
 
 
434 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  71.05 
 
 
434 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  38.58 
 
 
445 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.95 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.43 
 
 
443 aa  242  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  34.62 
 
 
457 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.49 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.1 
 
 
422 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  33.1 
 
 
422 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.43 
 
 
429 aa  230  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.52 
 
 
415 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  35.2 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  34.16 
 
 
436 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  35.51 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.73 
 
 
430 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.66 
 
 
437 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.42 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.68 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  33.87 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.46 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  29.71 
 
 
440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  31.05 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  32.82 
 
 
450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  32.39 
 
 
434 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  33.03 
 
 
443 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.71 
 
 
442 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.19 
 
 
432 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.14 
 
 
407 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  33.49 
 
 
443 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.51 
 
 
442 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.86 
 
 
450 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  33.57 
 
 
444 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  30.86 
 
 
441 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  32.73 
 
 
443 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  32.8 
 
 
443 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.25 
 
 
436 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  32.64 
 
 
450 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  32.14 
 
 
461 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.99 
 
 
446 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  33.33 
 
 
449 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  32.73 
 
 
435 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  34.29 
 
 
446 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  33.25 
 
 
439 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  33.1 
 
 
449 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.71 
 
 
444 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  33.49 
 
 
462 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.33 
 
 
434 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.52 
 
 
450 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.92 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.45 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.41 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.29 
 
 
441 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.65 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  34.55 
 
 
451 aa  200  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  29.22 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.8 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.16 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  30.84 
 
 
446 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.41 
 
 
445 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33.67 
 
 
421 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.86 
 
 
403 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  30.62 
 
 
434 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  31.45 
 
 
453 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.58 
 
 
445 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  30.18 
 
 
424 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.44 
 
 
427 aa  193  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.55 
 
 
446 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.21 
 
 
448 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  31.42 
 
 
443 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  31.57 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.21 
 
 
441 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  30.73 
 
 
429 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  32.13 
 
 
428 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.14 
 
 
444 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.14 
 
 
444 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  32.35 
 
 
425 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.49 
 
 
444 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  31.24 
 
 
454 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.03 
 
 
435 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  31.41 
 
 
461 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.04 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  30.88 
 
 
408 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.32 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  30.11 
 
 
431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.1 
 
 
446 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.1 
 
 
446 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  32.21 
 
 
439 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  29.89 
 
 
431 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  30.34 
 
 
431 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  31.41 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  30.16 
 
 
442 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  30.16 
 
 
442 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  30.16 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  29.43 
 
 
431 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  30.42 
 
 
440 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  30.15 
 
 
427 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  29.66 
 
 
431 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  29.72 
 
 
431 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>