More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1215 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  75.05 
 
 		 1094 aa  1715    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  73.72 
 
 		 1097 aa  1702    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  70.63 
 
 		 1094 aa  1621    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  70.08 
 
 		 1094 aa  1617    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  70.54 
 
 		 1094 aa  1619    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  70.45 
 
 		 1094 aa  1620    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  70.54 
 
 		 1094 aa  1620    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  100 
 
 		 1092 aa  2254    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  71 
 
 		 1093 aa  1626    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  71.09 
 
 		 1093 aa  1630    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  70.81 
 
 		 1104 aa  1635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  68.74 
 
 		 1094 aa  1545    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  71.36 
 
 		 1094 aa  1649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  70.81 
 
 		 1093 aa  1626    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  66.24 
 
 		 1084 aa  1532    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.69 
 
 		 1167 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1059 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  28.57 
 
 		 1089 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  28.36 
 
 		 1104 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  27.51 
 
 		 1117 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.05 
 
 		 1079 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.07 
 
 		 1075 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  28.41 
 
 		 1016 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.12 
 
 		 1065 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  27.41 
 
 		 1069 aa  351  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  25.81 
 
 		 1147 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1051 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  29.78 
 
 		 1183 aa  292  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  26.15 
 
 		 1107 aa  290  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  29.31 
 
 		 1181 aa  286  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  27.65 
 
 		 1008 aa  284  7.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  38.17 
 
 		 1545 aa  261  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  37.95 
 
 		 1545 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.02 
 
 		 1090 aa  257  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.11 
 
 		 1067 aa  251  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.54 
 
 		 1082 aa  251  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  22.99 
 
 		 1097 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.62 
 
 		 1125 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  30.69 
 
 		 1186 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.92 
 
 		 1084 aa  185  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.81 
 
 		 1193 aa  180  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  40.76 
 
 		 1484 aa  170  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.75 
 
 		 1076 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  24.08 
 
 		 1354 aa  135  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  26.9 
 
 		 482 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  26.17 
 
 		 428 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.11 
 
 		 483 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  26.05 
 
 		 425 aa  94.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.47 
 
 		 427 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.47 
 
 		 465 aa  87  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  26.73 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.07 
 
 		 389 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  24.38 
 
 		 429 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  24.53 
 
 		 430 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  23.41 
 
 		 432 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  24.11 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.72 
 
 		 428 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  24.07 
 
 		 444 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.7 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  28.41 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  23.81 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  22.03 
 
 		 1081 aa  65.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  23.63 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  23.63 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.15 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  21.27 
 
 		 1069 aa  64.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  22.95 
 
 		 447 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  23.43 
 
 		 433 aa  64.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  21.46 
 
 		 1071 aa  62.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  24.08 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 		 427 aa  62  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  22.74 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 377 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  23.54 
 
 		 1138 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.7 
 
 		 428 aa  61.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.43 
 
 		 418 aa  60.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.95 
 
 		 453 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  23.58 
 
 		 429 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  24.24 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  24.35 
 
 		 434 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  24.39 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  21.57 
 
 		 1066 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  22.69 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  24.39 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  23.64 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.86 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  24.4 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  28.57 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  20.74 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>