More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0392 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  100 
 
 
354 aa  721    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.31 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  32.98 
 
 
419 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  27.89 
 
 
416 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.21 
 
 
434 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  38.71 
 
 
292 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  28.73 
 
 
422 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.73 
 
 
422 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.25 
 
 
434 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  28.62 
 
 
615 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  28.31 
 
 
443 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.64 
 
 
717 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  28.75 
 
 
444 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.22 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  27.92 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.05 
 
 
425 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  27.92 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.87 
 
 
446 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  30.85 
 
 
461 aa  95.9  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  27.08 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.04 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.32 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  28.23 
 
 
454 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  27.08 
 
 
434 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.08 
 
 
434 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.22 
 
 
430 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  26.55 
 
 
461 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.15 
 
 
427 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  31.67 
 
 
620 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.87 
 
 
446 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.67 
 
 
430 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.87 
 
 
446 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  26.67 
 
 
441 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.33 
 
 
437 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.45 
 
 
1042 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30.41 
 
 
451 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  24.76 
 
 
436 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.6 
 
 
429 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  28.96 
 
 
442 aa  92.8  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.2 
 
 
443 aa  92.8  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.44 
 
 
432 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.56 
 
 
430 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.46 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  27.31 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  23.18 
 
 
1040 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  26.52 
 
 
443 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  24.76 
 
 
462 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.92 
 
 
450 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  23.18 
 
 
1042 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.26 
 
 
407 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  26.18 
 
 
421 aa  89.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  27.66 
 
 
435 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  26.09 
 
 
440 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.36 
 
 
446 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  28.16 
 
 
429 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  26.96 
 
 
438 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  27.81 
 
 
428 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  32.45 
 
 
567 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.54 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.13 
 
 
446 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  26.62 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  30 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  26.15 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.7 
 
 
427 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  26.48 
 
 
435 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  26.48 
 
 
435 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.14 
 
 
444 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.67 
 
 
430 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  24.76 
 
 
444 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.64 
 
 
444 aa  86.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.72 
 
 
407 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  29 
 
 
450 aa  86.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  28.72 
 
 
435 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.18 
 
 
424 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  29.12 
 
 
440 aa  85.9  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  27.06 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  28.65 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  24.76 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.41 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.05 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.25 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.47 
 
 
572 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.94 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 
969 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  26.22 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  25 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  24.76 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  26.94 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  31.61 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  27.47 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  24.26 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  24.27 
 
 
449 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.42 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.89 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  27.87 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  27.87 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  27.87 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  26.63 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  26.63 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  26.42 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>