More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1680 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  44.9 
 
 		 1071 aa  986    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  45.94 
 
 		 1062 aa  1007    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  43.98 
 
 		 1111 aa  942    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  45.42 
 
 		 1049 aa  993    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  47.57 
 
 		 1069 aa  1065    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  42.37 
 
 		 1084 aa  898    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  47.49 
 
 		 1081 aa  1048    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  46.04 
 
 		 1062 aa  1006    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  47.04 
 
 		 1067 aa  1040    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  45.77 
 
 		 1065 aa  1022    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  45.98 
 
 		 1066 aa  1029    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  56.23 
 
 		 1078 aa  1216    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  44.32 
 
 		 1113 aa  942    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  45.75 
 
 		 1062 aa  1004    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  45.66 
 
 		 1062 aa  1000    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  45.84 
 
 		 1062 aa  1006    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  46.49 
 
 		 1060 aa  1053    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  100 
 
 		 1062 aa  2155    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  45.38 
 
 		 1062 aa  998    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  46.03 
 
 		 1062 aa  1007    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  45.78 
 
 		 1062 aa  1021    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  47.4 
 
 		 1138 aa  976    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  43.85 
 
 		 598 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  47.66 
 
 		 445 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28.46 
 
 		 1052 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1042 aa  227  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  27.52 
 
 		 1040 aa  226  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  27.11 
 
 		 1042 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.81 
 
 		 1005 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.37 
 
 		 1059 aa  201  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  25.81 
 
 		 1031 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.72 
 
 		 1014 aa  170  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.42 
 
 		 1010 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  27.89 
 
 		 441 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.51 
 
 		 666 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.19 
 
 		 1090 aa  100  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.44 
 
 		 483 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  23.96 
 
 		 1082 aa  94.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.5 
 
 		 717 aa  94.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  25.81 
 
 		 1167 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.71 
 
 		 1097 aa  94.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  26.21 
 
 		 451 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  27.65 
 
 		 1125 aa  92  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.13 
 
 		 433 aa  91.7  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.14 
 
 		 590 aa  91.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.56 
 
 		 568 aa  91.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  28.18 
 
 		 438 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  25.73 
 
 		 455 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  23.84 
 
 		 426 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.61 
 
 		 478 aa  89.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.17 
 
 		 470 aa  88.6  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  24.73 
 
 		 585 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.2 
 
 		 440 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  24.95 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  26.61 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  25.22 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  24.44 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.98 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.08 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.49 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  26.26 
 
 		 819 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  23.7 
 
 		 686 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  35.87 
 
 		 427 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  25 
 
 		 459 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.82 
 
 		 430 aa  80.9  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  33.52 
 
 		 1067 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  34.38 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  27.38 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  25.4 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.37 
 
 		 572 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  23 
 
 		 407 aa  77.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  24.42 
 
 		 444 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.3 
 
 		 433 aa  76.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  28.85 
 
 		 445 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25.36 
 
 		 435 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.96 
 
 		 423 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  23.24 
 
 		 438 aa  77  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  24.24 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  25.73 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.44 
 
 		 670 aa  75.5  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.27 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  32.45 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.56 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.94 
 
 		 401 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  25.37 
 
 		 441 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  25.34 
 
 		 702 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 		 642 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.79 
 
 		 432 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 421 aa  73.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  22.71 
 
 		 1084 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.71 
 
 		 446 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.36 
 
 		 446 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.71 
 
 		 446 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  23.8 
 
 		 1046 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  26.16 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.73 
 
 		 567 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  23.02 
 
 		 1104 aa  72  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.37 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.9 
 
 		 407 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.26 
 
 		 441 aa  70.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>