198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  39.06 
 
 		 1147 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  38.27 
 
 		 1107 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  100 
 
 		 1186 aa  2345    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  36.32 
 
 		 1181 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  40.34 
 
 		 1051 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  42.06 
 
 		 1069 aa  778    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  34.05 
 
 		 1089 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  42.42 
 
 		 1183 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  33.58 
 
 		 1104 aa  515  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  32.6 
 
 		 1117 aa  515  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  28.16 
 
 		 1167 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  38.65 
 
 		 1059 aa  346  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  39.4 
 
 		 1016 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  33.84 
 
 		 1065 aa  327  9e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  24.62 
 
 		 1079 aa  321  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  35.53 
 
 		 1008 aa  290  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  24.29 
 
 		 1075 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  26.42 
 
 		 1097 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  25.61 
 
 		 1354 aa  283  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  25.63 
 
 		 1094 aa  266  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  28.19 
 
 		 1094 aa  230  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  30.63 
 
 		 1093 aa  226  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  30.35 
 
 		 1093 aa  225  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  30.51 
 
 		 1092 aa  224  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  30.44 
 
 		 1093 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  30.3 
 
 		 1094 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  30.45 
 
 		 1094 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  30.45 
 
 		 1094 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  29.53 
 
 		 1084 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  30.45 
 
 		 1094 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  30.32 
 
 		 1094 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  29.47 
 
 		 1104 aa  211  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  25.92 
 
 		 1094 aa  197  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  32.91 
 
 		 1193 aa  152  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  32.55 
 
 		 1082 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  30.3 
 
 		 1067 aa  147  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.17 
 
 		 1097 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  31.06 
 
 		 1090 aa  140  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  26.62 
 
 		 1545 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  26.62 
 
 		 1545 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  32.73 
 
 		 1484 aa  115  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  26.58 
 
 		 1125 aa  113  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  27.22 
 
 		 1084 aa  96.3  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.28 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  24.26 
 
 		 1076 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  25.25 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.55 
 
 		 425 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  23.92 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.18 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  20.65 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  25.58 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 440 aa  60.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  25.53 
 
 		 389 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.1 
 
 		 720 aa  57.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  24.67 
 
 		 440 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  35.42 
 
 		 1071 aa  56.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  34.44 
 
 		 1138 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  23.19 
 
 		 426 aa  55.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  23.79 
 
 		 395 aa  55.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  23.51 
 
 		 428 aa  54.7  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  23.74 
 
 		 444 aa  54.7  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  25.36 
 
 		 472 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  21.85 
 
 		 412 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  31.58 
 
 		 1062 aa  54.3  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  34.07 
 
 		 1062 aa  53.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  36.54 
 
 		 1062 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  22.83 
 
 		 444 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1069 aa  53.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  22.56 
 
 		 432 aa  53.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.3 
 
 		 446 aa  53.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  40.74 
 
 		 428 aa  53.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  32.61 
 
 		 1060 aa  53.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  33.67 
 
 		 1062 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  33.67 
 
 		 1062 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  38.46 
 
 		 437 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  32.69 
 
 		 1049 aa  52.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 442 aa  52.4  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.53 
 
 		 670 aa  52.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.74 
 
 		 401 aa  52.4  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  33.67 
 
 		 445 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  31.58 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  22.64 
 
 		 509 aa  52  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  32.97 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  31.25 
 
 		 1081 aa  52  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  31.58 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  23.77 
 
 		 457 aa  52  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 		 458 aa  52  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  19.93 
 
 		 397 aa  52  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  34.44 
 
 		 1067 aa  52  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  25.14 
 
 		 444 aa  52  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  25.95 
 
 		 377 aa  51.6  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 437 aa  51.6  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  24.03 
 
 		 444 aa  51.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  22.88 
 
 		 428 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  24.3 
 
 		 507 aa  51.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>