More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2750 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  100 
 
 
1076 aa  2227    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  35.12 
 
 
1084 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  33.68 
 
 
1125 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  29.82 
 
 
1067 aa  445  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.99 
 
 
1097 aa  344  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.25 
 
 
1090 aa  331  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.71 
 
 
1082 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  25.11 
 
 
1167 aa  274  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  25.94 
 
 
1075 aa  274  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  24.42 
 
 
1079 aa  262  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  23.65 
 
 
1104 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.53 
 
 
1193 aa  189  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  21.66 
 
 
1097 aa  187  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  21.7 
 
 
1094 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  22.54 
 
 
1094 aa  169  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  21.75 
 
 
1092 aa  164  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  21.31 
 
 
1094 aa  162  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  21.75 
 
 
1094 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  21.52 
 
 
1093 aa  159  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  21.18 
 
 
1094 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  21.41 
 
 
1094 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  21.52 
 
 
1093 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  21.15 
 
 
1094 aa  155  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  21.11 
 
 
1094 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  21.34 
 
 
1093 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  21.1 
 
 
1084 aa  152  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  22.66 
 
 
1016 aa  145  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  21.08 
 
 
1065 aa  142  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  21.65 
 
 
1008 aa  125  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  21.86 
 
 
1069 aa  122  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  22.82 
 
 
1107 aa  115  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.84 
 
 
1005 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  23.06 
 
 
1104 aa  110  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  26.23 
 
 
1089 aa  109  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  23.79 
 
 
1117 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  24.62 
 
 
1059 aa  99.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  25.18 
 
 
1183 aa  99  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  24.05 
 
 
1181 aa  94.7  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  24.26 
 
 
1186 aa  94  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.53 
 
 
1067 aa  89.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  23.48 
 
 
1051 aa  89  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  25.28 
 
 
1066 aa  88.2  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  23.88 
 
 
425 aa  88.2  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  24.49 
 
 
1062 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  23.81 
 
 
969 aa  85.5  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  24.49 
 
 
1062 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  24.49 
 
 
1062 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  21.56 
 
 
1147 aa  81.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  24.08 
 
 
1062 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.04 
 
 
1069 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.58 
 
 
1065 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.81 
 
 
1062 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.2 
 
 
445 aa  79  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  24.89 
 
 
1062 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.09 
 
 
1014 aa  76.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  24.66 
 
 
1062 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.81 
 
 
1071 aa  74.7  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  39.05 
 
 
572 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  29.55 
 
 
430 aa  73.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  23.37 
 
 
428 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.57 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  22.94 
 
 
1545 aa  72.4  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  24.15 
 
 
1049 aa  72  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.35 
 
 
717 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  29.09 
 
 
430 aa  72  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.68 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  21.39 
 
 
1059 aa  71.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  27.78 
 
 
1010 aa  71.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  22.96 
 
 
1545 aa  70.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  29.87 
 
 
316 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  22.99 
 
 
1052 aa  68.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.27 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.41 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  21.37 
 
 
1031 aa  68.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.8 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  22.39 
 
 
1354 aa  68.2  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  37.07 
 
 
1062 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.06 
 
 
590 aa  66.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  44.59 
 
 
1060 aa  66.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.49 
 
 
432 aa  65.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.47 
 
 
428 aa  65.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  25.88 
 
 
354 aa  65.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  25.93 
 
 
444 aa  65.1  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  22.3 
 
 
419 aa  64.7  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  35.64 
 
 
292 aa  64.7  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  37.07 
 
 
1081 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  35 
 
 
415 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25.46 
 
 
449 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  25.35 
 
 
450 aa  64.3  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25 
 
 
462 aa  64.3  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.68 
 
 
407 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  34.58 
 
 
296 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  22.83 
 
 
918 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.94 
 
 
450 aa  63.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.03 
 
 
421 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  35 
 
 
438 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.12 
 
 
407 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.08 
 
 
497 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.62 
 
 
425 aa  62.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.82 
 
 
446 aa  62.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>