272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0480 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  46.11 
 
 		 1008 aa  870    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  40.87 
 
 		 1117 aa  762    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  39.22 
 
 		 1065 aa  695    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  42.76 
 
 		 1059 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  100 
 
 		 1016 aa  2046    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  41.84 
 
 		 1104 aa  771    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  40.98 
 
 		 1089 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  37.94 
 
 		 1069 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1051 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  34.61 
 
 		 1107 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  33.74 
 
 		 1147 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  30.91 
 
 		 1167 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  32.03 
 
 		 1183 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.96 
 
 		 1079 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  35.95 
 
 		 1181 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  29.68 
 
 		 1093 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  29.78 
 
 		 1093 aa  386  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  30.41 
 
 		 1084 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  29.54 
 
 		 1094 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  29.49 
 
 		 1093 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  29.29 
 
 		 1094 aa  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  29.43 
 
 		 1094 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  29.17 
 
 		 1094 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  29.08 
 
 		 1094 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  28.41 
 
 		 1092 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  28.56 
 
 		 1097 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  28.64 
 
 		 1094 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  29.71 
 
 		 1104 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  28.8 
 
 		 1094 aa  370  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.5 
 
 		 1075 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  39.4 
 
 		 1186 aa  339  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  26.31 
 
 		 1094 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.8 
 
 		 1082 aa  283  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.46 
 
 		 1067 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.18 
 
 		 1097 aa  217  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  28 
 
 		 1354 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  32.31 
 
 		 1090 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  27.38 
 
 		 1193 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  28.14 
 
 		 1545 aa  138  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  27.91 
 
 		 1545 aa  137  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  22.66 
 
 		 1076 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  27.31 
 
 		 1125 aa  128  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  22.01 
 
 		 1084 aa  121  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  26.7 
 
 		 427 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.5 
 
 		 428 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  27.39 
 
 		 1484 aa  90.5  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  26.33 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  25.62 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.5 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.17 
 
 		 465 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  24.68 
 
 		 432 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  24.26 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.92 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  24.16 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.78 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  23.17 
 
 		 427 aa  64.3  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  21.7 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.74 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  21.7 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  23.28 
 
 		 429 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  24.32 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  28.69 
 
 		 717 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 		 969 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.11 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  36.36 
 
 		 1138 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  27.21 
 
 		 347 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  26.9 
 
 		 509 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 		 642 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33 
 
 		 444 aa  55.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  23.68 
 
 		 412 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  37 
 
 		 434 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34 
 
 		 434 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 1831 aa  55.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  23.13 
 
 		 1062 aa  55.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.78 
 
 		 446 aa  55.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  21.15 
 
 		 440 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.25 
 
 		 426 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  34 
 
 		 434 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  21.18 
 
 		 440 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  35.11 
 
 		 1113 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.81 
 
 		 590 aa  54.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  29.14 
 
 		 404 aa  54.3  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.36 
 
 		 572 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  37 
 
 		 443 aa  53.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  25.2 
 
 		 446 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31 
 
 		 437 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  22.75 
 
 		 444 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  21.91 
 
 		 475 aa  53.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  29.86 
 
 		 430 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  34.29 
 
 		 441 aa  53.5  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  28.87 
 
 		 472 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  37.04 
 
 		 461 aa  53.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.53 
 
 		 1005 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 377 aa  52.8  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.47 
 
 		 664 aa  53.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.08 
 
 		 1059 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>