More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2415 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  65.3 
 
 		 1094 aa  1474    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  64.78 
 
 		 1094 aa  1468    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  64.59 
 
 		 1094 aa  1474    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  65.49 
 
 		 1104 aa  1466    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  64.57 
 
 		 1094 aa  1461    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  66.24 
 
 		 1092 aa  1532    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  65.57 
 
 		 1094 aa  1486    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  64.57 
 
 		 1094 aa  1460    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  64.47 
 
 		 1094 aa  1459    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  64.11 
 
 		 1097 aa  1451    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  65.32 
 
 		 1093 aa  1481    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  65.42 
 
 		 1093 aa  1480    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  63.35 
 
 		 1094 aa  1444    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  65.6 
 
 		 1093 aa  1484    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  100 
 
 		 1084 aa  2205    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  31 
 
 		 1104 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  30.55 
 
 		 1117 aa  445  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1059 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  31.32 
 
 		 1089 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.72 
 
 		 1167 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.81 
 
 		 1079 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  30.41 
 
 		 1016 aa  385  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  26.04 
 
 		 1065 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  29.3 
 
 		 1069 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.27 
 
 		 1075 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1051 aa  330  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  28.11 
 
 		 1107 aa  325  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  32.39 
 
 		 1183 aa  291  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  30.82 
 
 		 1181 aa  283  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  28.17 
 
 		 1008 aa  283  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  27 
 
 		 1067 aa  259  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  37.3 
 
 		 1545 aa  251  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  37.07 
 
 		 1545 aa  250  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.62 
 
 		 1090 aa  239  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  24.19 
 
 		 1097 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.82 
 
 		 1082 aa  221  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  25.02 
 
 		 1125 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  30.63 
 
 		 1147 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  30.06 
 
 		 1186 aa  210  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  22.81 
 
 		 1084 aa  188  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  38.93 
 
 		 1484 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.66 
 
 		 1193 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.1 
 
 		 1076 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  27.58 
 
 		 1354 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  27.23 
 
 		 389 aa  92.8  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.23 
 
 		 428 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  26.42 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.91 
 
 		 427 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  22.17 
 
 		 425 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.98 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  25.43 
 
 		 430 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  24.94 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.44 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.19 
 
 		 1031 aa  75.1  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1042 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.35 
 
 		 1040 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.43 
 
 		 1069 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  23.54 
 
 		 429 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  26.48 
 
 		 1071 aa  69.7  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.88 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  22.45 
 
 		 1060 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.21 
 
 		 1067 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  23.97 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.75 
 
 		 1066 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  23.49 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.63 
 
 		 457 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1042 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.21 
 
 		 1081 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.69 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  26.15 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.37 
 
 		 1059 aa  65.1  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  23.03 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  23.62 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  22.53 
 
 		 1062 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  23.96 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  21.47 
 
 		 1062 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  23.96 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  22.85 
 
 		 1062 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  24.37 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  22.29 
 
 		 1062 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  21.63 
 
 		 1062 aa  62.4  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 426 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 423 aa  62  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  23.71 
 
 		 428 aa  62  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  22.66 
 
 		 1062 aa  62  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.91 
 
 		 397 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  22.9 
 
 		 445 aa  61.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  22.47 
 
 		 496 aa  60.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  22.66 
 
 		 1062 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  22.47 
 
 		 496 aa  60.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  26.23 
 
 		 389 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.47 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.37 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  35.11 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  22.91 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  26.07 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  27.92 
 
 		 737 aa  58.9  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>