More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2230 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  38.54 
 
 		 1005 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  96.55 
 
 		 1040 aa  1943    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  100 
 
 		 1042 aa  2062    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  50.69 
 
 		 1059 aa  889    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  95.97 
 
 		 1042 aa  1929    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  46.55 
 
 		 1031 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  39.13 
 
 		 1014 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  37.75 
 
 		 1010 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  26.08 
 
 		 1067 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  25.58 
 
 		 1060 aa  235  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.72 
 
 		 1062 aa  231  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  26.9 
 
 		 1138 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  26.17 
 
 		 1049 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  27.85 
 
 		 1062 aa  229  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.33 
 
 		 1062 aa  227  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.69 
 
 		 1062 aa  226  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.69 
 
 		 1062 aa  225  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.59 
 
 		 1062 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.54 
 
 		 1062 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1062 aa  221  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.54 
 
 		 1065 aa  217  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  25.07 
 
 		 1066 aa  217  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.51 
 
 		 1069 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25.38 
 
 		 1062 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  25.3 
 
 		 1078 aa  214  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25.05 
 
 		 1081 aa  213  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.67 
 
 		 1071 aa  212  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.34 
 
 		 1084 aa  195  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.12 
 
 		 1111 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.53 
 
 		 1113 aa  174  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  23.02 
 
 		 1052 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  29.38 
 
 		 445 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.2 
 
 		 1082 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.63 
 
 		 686 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.08 
 
 		 1097 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  24.95 
 
 		 598 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.52 
 
 		 1090 aa  106  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 969 aa  99.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.02 
 
 		 459 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.42 
 
 		 445 aa  95.5  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  35.71 
 
 		 572 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.1 
 
 		 717 aa  94.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.71 
 
 		 590 aa  94  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.89 
 
 		 430 aa  93.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.33 
 
 		 567 aa  92.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  40.85 
 
 		 457 aa  92  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 444 aa  91.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  27.74 
 
 		 1125 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.24 
 
 		 444 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.24 
 
 		 444 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  24.14 
 
 		 354 aa  89.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  23.98 
 
 		 680 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 424 aa  88.2  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.88 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.79 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.7 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.09 
 
 		 1067 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1209  winged helix family two component response transcriptional regulator  22.36 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310847  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  31.82 
 
 		 437 aa  84  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  31.82 
 
 		 440 aa  84.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.07 
 
 		 430 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  32.29 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.29 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.79 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28 
 
 		 441 aa  83.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.52 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.89 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.91 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  27.08 
 
 		 485 aa  81.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 642 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.77 
 
 		 1028 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  36 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  35.44 
 
 		 428 aa  80.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  26.97 
 
 		 316 aa  80.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 428 aa  80.1  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.88 
 
 		 590 aa  80.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  25.96 
 
 		 1167 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.5 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.55 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  30.15 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  25.84 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  25.38 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  35.53 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.98 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  28.79 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  28.79 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  27.16 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  28.79 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  28.79 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.26 
 
 		 1084 aa  78.2  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  27.64 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  26.57 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  30.97 
 
 		 442 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  34.56 
 
 		 450 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 442 aa  77.4  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  29.49 
 
 		 352 aa  77.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  29.59 
 
 		 432 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  22.85 
 
 		 426 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>