More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0681 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  100 
 
 		 432 aa  862    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  57.81 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  55.18 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  44.11 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  44.15 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  43.56 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  43.53 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  43.07 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  40.42 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  45.45 
 
 		 455 aa  299  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  42.08 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  41.22 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  41.31 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  40 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  38.07 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  39.34 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  38.94 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  41.05 
 
 		 444 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  39.07 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  41.71 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  39.86 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  38.2 
 
 		 428 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  40 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  37.3 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  37.38 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  37.44 
 
 		 414 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  35.89 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  35.73 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  36.3 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  37.44 
 
 		 429 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  35.14 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  38.35 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.15 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  36.43 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  38.69 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  33.64 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  36.65 
 
 		 424 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  35.29 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  36.34 
 
 		 421 aa  203  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  36.55 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  38.12 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  38.12 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  36.73 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  38.12 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  38.92 
 
 		 402 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  35.44 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  35.44 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  35.44 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.25 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  33.81 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.65 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  34.52 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  37.8 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  35.79 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.18 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  35.29 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  34.55 
 
 		 420 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.02 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  32.26 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  36.09 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  36.36 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  36.36 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  36.36 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.46 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  38.27 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.92 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.25 
 
 		 413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.17 
 
 		 426 aa  173  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.05 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  34.27 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  33.98 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  33.8 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  31.62 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.04 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.6 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  33.88 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  33.25 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  33.86 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.2 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  35.05 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  33.88 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.01 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.18 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  30.23 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  31.31 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.84 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.59 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  34.92 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.86 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  34.61 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.19 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  32.06 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.71 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.04 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.16 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.08 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  34.27 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.41 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>