More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1803 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  100 
 
 		 1052 aa  2176    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  31.54 
 
 		 1084 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  30.61 
 
 		 1078 aa  412  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  28.47 
 
 		 1062 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  29.11 
 
 		 1062 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  28.38 
 
 		 1069 aa  396  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  28.21 
 
 		 1067 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  27.53 
 
 		 1065 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  27.99 
 
 		 1060 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  28.1 
 
 		 1081 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  28.68 
 
 		 1062 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  28.17 
 
 		 1066 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  28.84 
 
 		 1138 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  28.38 
 
 		 1062 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  28.68 
 
 		 1062 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  28.57 
 
 		 1071 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  28.58 
 
 		 1062 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  27.5 
 
 		 1062 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  27.05 
 
 		 1062 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  27.21 
 
 		 1062 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  26.52 
 
 		 1049 aa  362  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  28.12 
 
 		 1113 aa  356  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  26.91 
 
 		 1111 aa  353  7e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  29.47 
 
 		 598 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.58 
 
 		 1005 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  22.82 
 
 		 1014 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1042 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  22.78 
 
 		 1042 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  22.95 
 
 		 1040 aa  160  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  30.05 
 
 		 445 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  25.19 
 
 		 1031 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.35 
 
 		 1059 aa  146  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.59 
 
 		 470 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  25.45 
 
 		 430 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.3 
 
 		 407 aa  99.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.24 
 
 		 483 aa  89.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.46 
 
 		 431 aa  88.2  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.46 
 
 		 438 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.8 
 
 		 430 aa  87.4  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  23.88 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  22.74 
 
 		 1010 aa  85.9  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  24.21 
 
 		 496 aa  84.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  25.24 
 
 		 405 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  22.06 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  24.28 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.91 
 
 		 672 aa  82  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.7 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.36 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  25.05 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  25.17 
 
 		 412 aa  80.9  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  24.09 
 
 		 412 aa  80.9  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  23.84 
 
 		 455 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  23.23 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  24.18 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  25.52 
 
 		 543 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  24.76 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  21.9 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.5 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  25.06 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  24.75 
 
 		 819 aa  74.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.43 
 
 		 433 aa  73.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  23.47 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  24.27 
 
 		 409 aa  72  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.53 
 
 		 407 aa  72  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  33.15 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  32.56 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  24.71 
 
 		 405 aa  71.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  24.7 
 
 		 441 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.52 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  24.31 
 
 		 421 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  24.17 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  23.63 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  24.57 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  34.11 
 
 		 572 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  41.98 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  23.8 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  22.78 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  22.99 
 
 		 1076 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  23.42 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  21.51 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  22.89 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  22.86 
 
 		 444 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  25.23 
 
 		 437 aa  67  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  24.78 
 
 		 478 aa  67.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  25.52 
 
 		 435 aa  67  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  32.31 
 
 		 419 aa  67  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  22.86 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  24.76 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  48.57 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  23.28 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  22.86 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  21.89 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  36.46 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  23.34 
 
 		 412 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  38.64 
 
 		 434 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  31.78 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  23.66 
 
 		 432 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  37.36 
 
 		 511 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  40.23 
 
 		 568 aa  64.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  25.47 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>