More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0755 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  100 
 
 
457 aa  933    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  38.76 
 
 
438 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.57 
 
 
443 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  38.7 
 
 
427 aa  292  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  36.22 
 
 
432 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.18 
 
 
429 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  38.39 
 
 
435 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  36.51 
 
 
440 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  39.37 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  36.36 
 
 
445 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.8 
 
 
407 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.74 
 
 
444 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  34.78 
 
 
444 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.08 
 
 
407 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.08 
 
 
446 aa  256  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  37.28 
 
 
449 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34.48 
 
 
426 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.58 
 
 
441 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  35.43 
 
 
440 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  35.06 
 
 
450 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  34.42 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.33 
 
 
427 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35 
 
 
450 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  33.04 
 
 
436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.83 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  32.65 
 
 
443 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.88 
 
 
425 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  33.41 
 
 
429 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  33.17 
 
 
438 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  32.78 
 
 
450 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  32.43 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  34.1 
 
 
428 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  34.3 
 
 
421 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.93 
 
 
440 aa  233  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  34.81 
 
 
437 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  35.87 
 
 
442 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  34.14 
 
 
408 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  33.63 
 
 
439 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  31.85 
 
 
449 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  33.03 
 
 
441 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  31.62 
 
 
444 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  31.7 
 
 
450 aa  226  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33.25 
 
 
421 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  33.98 
 
 
434 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  31.38 
 
 
449 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.26 
 
 
446 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.22 
 
 
434 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  34.22 
 
 
434 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  33.58 
 
 
462 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  32.53 
 
 
454 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.55 
 
 
435 aa  223  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  32.12 
 
 
450 aa  223  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  31.6 
 
 
435 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  32.85 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.85 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  33.04 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  31.35 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.12 
 
 
444 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.12 
 
 
444 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.71 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.77 
 
 
415 aa  220  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  32.19 
 
 
436 aa  220  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.25 
 
 
427 aa  220  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  32.6 
 
 
453 aa  219  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.67 
 
 
441 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  33.65 
 
 
419 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  32.06 
 
 
435 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  31 
 
 
443 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  30.79 
 
 
443 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  33.65 
 
 
419 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.86 
 
 
432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.56 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  31.49 
 
 
439 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  34.47 
 
 
428 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  30.57 
 
 
443 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.02 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  31.52 
 
 
435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  31.57 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  34.16 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  33.75 
 
 
403 aa  213  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  31.49 
 
 
432 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  31.19 
 
 
445 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  34.16 
 
 
424 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.62 
 
 
446 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.02 
 
 
434 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  31.53 
 
 
439 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  32.36 
 
 
437 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  30.77 
 
 
433 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  32.73 
 
 
430 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  32.73 
 
 
430 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  30.42 
 
 
442 aa  205  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  31.53 
 
 
474 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  32.73 
 
 
430 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.57 
 
 
450 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.42 
 
 
430 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  32.05 
 
 
432 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  30.97 
 
 
423 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  30.11 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  31.44 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  30.2 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>