More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1774 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  40.71 
 
 		 1005 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  45.36 
 
 		 1010 aa  807    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  100 
 
 		 1014 aa  2057    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  39.78 
 
 		 1042 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  39.26 
 
 		 1040 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  39.23 
 
 		 1042 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  37.99 
 
 		 1059 aa  562  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  35.53 
 
 		 1031 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.07 
 
 		 1067 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.72 
 
 		 1062 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.82 
 
 		 1062 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  25.4 
 
 		 1066 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.54 
 
 		 1062 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25.68 
 
 		 1062 aa  218  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.93 
 
 		 1062 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1062 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.54 
 
 		 1062 aa  214  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.16 
 
 		 1062 aa  214  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  24.98 
 
 		 1049 aa  208  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  24.72 
 
 		 1065 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.83 
 
 		 1060 aa  196  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.25 
 
 		 1081 aa  195  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.7 
 
 		 1069 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.28 
 
 		 1071 aa  187  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.67 
 
 		 1138 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  22.82 
 
 		 1084 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.61 
 
 		 1062 aa  171  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  23.01 
 
 		 1052 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1111 aa  168  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1078 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.27 
 
 		 1113 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  30.75 
 
 		 686 aa  139  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  26.89 
 
 		 445 aa  115  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.97 
 
 		 680 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  25.05 
 
 		 598 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  25 
 
 		 672 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.48 
 
 		 1097 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.24 
 
 		 478 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.67 
 
 		 430 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.68 
 
 		 434 aa  97.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  24.93 
 
 		 470 aa  96.3  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  23.75 
 
 		 484 aa  94.7  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  24.69 
 
 		 666 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.23 
 
 		 433 aa  92.8  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.55 
 
 		 426 aa  91.3  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.17 
 
 		 444 aa  91.3  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.93 
 
 		 483 aa  91.3  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.34 
 
 		 1090 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  26.58 
 
 		 1125 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.58 
 
 		 1082 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  29.37 
 
 		 692 aa  89.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.38 
 
 		 567 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  27.62 
 
 		 717 aa  88.2  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.14 
 
 		 572 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.11 
 
 		 426 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.72 
 
 		 437 aa  87  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.25 
 
 		 590 aa  87  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.6 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.21 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  26.27 
 
 		 438 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  28.75 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  26.43 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  25.74 
 
 		 585 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  24.43 
 
 		 438 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.33 
 
 		 445 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  25.84 
 
 		 819 aa  80.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  24.89 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.38 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  29.5 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  32.04 
 
 		 398 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  32.38 
 
 		 442 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.28 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  23.57 
 
 		 407 aa  76.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  32.86 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  22.12 
 
 		 1076 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.86 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  25.44 
 
 		 702 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  29.28 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  25 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  23.93 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  24.94 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  23.74 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  26.67 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  30.85 
 
 		 1951 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.34 
 
 		 667 aa  75.1  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.13 
 
 		 1067 aa  75.1  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1101  transcriptional regulator domain-containing protein  28.19 
 
 		 713 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000631181  hitchhiker  0.00725129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  38.46 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  25.23 
 
 		 656 aa  74.7  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  24.12 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.85 
 
 		 427 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  36.44 
 
 		 430 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  35.04 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  27.45 
 
 		 1084 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.2 
 
 		 656 aa  73.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  22.46 
 
 		 969 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  35.04 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  31.18 
 
 		 352 aa  73.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  22.27 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>